Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

Predictions only

Length 759 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CUL4AQ13619 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CUL4AQ13619 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CUL4AQ13619 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CUL4AQ13619 ASNA1-205ENST00000611688 1214 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CUL4AQ13619 NDRG2-251ENST00000556147 2880 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CUL4AQ13619 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CUL4AQ13619 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CUL4AQ13619 IGHG4-202ENST00000641978 2597 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CUL4AQ13619 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CUL4AQ13619 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CUL4AQ13619 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CUL4AQ13619 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CUL4AQ13619 PPP2R1B-204ENST00000426998 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CUL4AQ13619 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CUL4AQ13619 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CUL4AQ13619 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CUL4AQ13619 IL1RL2-201ENST00000264257 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CUL4AQ13619 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CUL4AQ13619 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CUL4AQ13619 F2-205ENST00000530231 1849 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CUL4AQ13619 APCDD1L-AS1-203ENST00000427140 2092 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CUL4AQ13619 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CUL4AQ13619 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CUL4AQ13619 HOXC4-202ENST00000430889 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CUL4AQ13619 CSF2RB-203ENST00000406230 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CUL4AQ13619 ATP2C1-201ENST00000328560 3484 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CUL4AQ13619 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CUL4AQ13619 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CUL4AQ13619 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CUL4AQ13619 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CUL4AQ13619 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CUL4AQ13619 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CUL4AQ13619 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CUL4AQ13619 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CUL4AQ13619 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CUL4AQ13619 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CUL4AQ13619 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CUL4AQ13619 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CUL4AQ13619 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CUL4AQ13619 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CUL4AQ13619 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
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CUL4AQ13619 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CUL4AQ13619 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CUL4AQ13619 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
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CUL4AQ13619 KCNV1-201ENST00000297404 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CUL4AQ13619 TMEM25-201ENST00000313236 2409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CUL4AQ13619 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CUL4AQ13619 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CUL4AQ13619 RHD-209ENST00000568195 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CUL4AQ13619 APOB-202ENST00000399256 3128 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CUL4AQ13619 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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CUL4AQ13619 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CUL4AQ13619 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CUL4AQ13619 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CUL4AQ13619 C16orf82-201ENST00000418886 2268 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
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CUL4AQ13619 SCAMP5-202ENST00000425597 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CUL4AQ13619 AHCY-205ENST00000538132 2366 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CUL4AQ13619 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CUL4AQ13619 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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CUL4AQ13619 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CUL4AQ13619 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CUL4AQ13619 TNNI1-201ENST00000336092 1750 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
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CUL4AQ13619 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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CUL4AQ13619 VASH2-202ENST00000366964 2960 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
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CUL4AQ13619 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CUL4AQ13619 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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CUL4AQ13619 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
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CUL4AQ13619 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CUL4AQ13619 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
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CUL4AQ13619 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CUL4AQ13619 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CUL4AQ13619 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CUL4AQ13619 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CUL4AQ13619 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CUL4AQ13619 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CUL4AQ13619 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CUL4AQ13619 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CUL4AQ13619 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CUL4AQ13619 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CUL4AQ13619 EGR1-201ENST00000239938 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CUL4AQ13619 SEMA7A-202ENST00000542748 3228 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CUL4AQ13619 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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