Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 UBE2D3-210ENST00000453744 3990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 DCUN1D4-201ENST00000334635 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 PPFIA4-203ENST00000367240 6434 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 FRMD8-201ENST00000317568 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 ZFP36L2-201ENST00000282388 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 SEPT7-202ENST00000399034 4399 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 SLC4A8-205ENST00000535225 2262 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 FAM109A-201ENST00000361483 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 PTK7-203ENST00000345201 4071 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 GTPBP4-202ENST00000360803 5075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 DNM2-204ENST00000408974 3013 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 RIPOR1-204ENST00000428437 4152 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 FAM198B-201ENST00000296530 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 SPHK2-201ENST00000245222 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 HELLS-202ENST00000348459 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 KIAA0513-202ENST00000538274 7381 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 FFAR4-202ENST00000371483 3653 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 LIMD2-201ENST00000259006 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 Z82170.1-201ENST00000625081 3192 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 LRSAM1-203ENST00000373322 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 CCHCR1-203ENST00000396268 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 ATN1-201ENST00000356654 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 MICB-202ENST00000399150 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 CLPB-209ENST00000538039 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 TSPEAR-AS1-202ENST00000451035 2108 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 RFESD-201ENST00000311364 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 SLC46A1-208ENST00000618626 5363 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 AC093668.2-201ENST00000481893 3569 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 AC105052.1-201ENST00000519541 3569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 PCTP-207ENST00000576183 2680 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 PIK3R5-216ENST00000584803 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 SCML4-203ENST00000369022 2377 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 HOXA3-207ENST00000612286 3396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 SUV39H2-201ENST00000313519 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 RBBP8NL-201ENST00000252998 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 ADAM17-203ENST00000497134 1873 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 LHFPL2-201ENST00000380345 5043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms