Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TCOF1Q13428 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TCOF1Q13428 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TCOF1Q13428 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TCOF1Q13428 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TCOF1Q13428 TPM2-204ENST00000378300 1771 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TCOF1Q13428 UQCC2-204ENST00000607484 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TCOF1Q13428 C7orf61-201ENST00000332375 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TCOF1Q13428 CXorf40A-205ENST00000423540 1208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TCOF1Q13428 CSAG1-204ENST00000452779 627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TCOF1Q13428 GRPEL2P1-201ENST00000453145 339 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TCOF1Q13428 MIA-206ENST00000597784 455 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TCOF1Q13428 OCEL1-206ENST00000597836 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TCOF1Q13428 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TCOF1Q13428 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TCOF1Q13428 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TCOF1Q13428 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TCOF1Q13428 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TCOF1Q13428 SNX19-213ENST00000534726 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TCOF1Q13428 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TCOF1Q13428 RRAGA-201ENST00000380527 1589 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TCOF1Q13428 TBC1D27-202ENST00000424239 1573 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TCOF1Q13428 ERLIN1-202ENST00000407654 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TCOF1Q13428 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TCOF1Q13428 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TCOF1Q13428 LY86-202ENST00000379953 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TCOF1Q13428 RAD51C-203ENST00000421782 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TCOF1Q13428 AQP7P5-201ENST00000428759 1049 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TCOF1Q13428 BRI3P1-201ENST00000440440 378 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TCOF1Q13428 AQP7P4-201ENST00000447083 1042 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TCOF1Q13428 AQP7P2-201ENST00000453967 1041 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TCOF1Q13428 SIX3-AS1-202ENST00000456467 557 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TCOF1Q13428 AADACL2-AS1-202ENST00000483843 628 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TCOF1Q13428 LINC01485-202ENST00000520324 566 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TCOF1Q13428 AC003043.1-201ENST00000588260 337 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TCOF1Q13428 AQP7P3-201ENST00000624547 1041 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TCOF1Q13428 AL138720.1-201ENST00000629853 778 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TCOF1Q13428 AC027559.1-203ENST00000635726 517 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TCOF1Q13428 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TCOF1Q13428 DSG1-202ENST00000462981 1857 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TCOF1Q13428 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TCOF1Q13428 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TCOF1Q13428 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TCOF1Q13428 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TCOF1Q13428 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TCOF1Q13428 USP39-207ENST00000450066 2086 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TCOF1Q13428 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TCOF1Q13428 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TCOF1Q13428 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TCOF1Q13428 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TCOF1Q13428 COQ3-201ENST00000254759 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TCOF1Q13428 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TCOF1Q13428 SPATA8-201ENST00000328504 1083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TCOF1Q13428 AC108734.2-201ENST00000420887 1069 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TCOF1Q13428 LINC00866-201ENST00000427379 418 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TCOF1Q13428 GS1-124K5.4-201ENST00000445681 540 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
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TCOF1Q13428 AP001269.2-201ENST00000590055 379 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TCOF1Q13428 AC010504.1-201ENST00000591311 585 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TCOF1Q13428 ZNF677-204ENST00000594681 935 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TCOF1Q13428 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TCOF1Q13428 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TCOF1Q13428 TMEM9-202ENST00000367332 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TCOF1Q13428 TMBIM6-217ENST00000549385 2771 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TCOF1Q13428 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TCOF1Q13428 AC004554.1-201ENST00000422830 1468 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TCOF1Q13428 AC138761.6-201ENST00000583997 1423 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TCOF1Q13428 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TCOF1Q13428 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TCOF1Q13428 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TCOF1Q13428 OR2A25-202ENST00000641441 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TCOF1Q13428 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TCOF1Q13428 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TCOF1Q13428 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TCOF1Q13428 BCAS2-201ENST00000369541 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TCOF1Q13428 GULP1-204ENST00000409637 1242 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TCOF1Q13428 AC073210.1-201ENST00000414799 232 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TCOF1Q13428 AC156455.1-203ENST00000423999 893 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TCOF1Q13428 AC253536.3-201ENST00000444093 558 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TCOF1Q13428 STK24P1-201ENST00000455035 1291 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TCOF1Q13428 CD81-209ENST00000492627 886 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TCOF1Q13428 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TCOF1Q13428 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TCOF1Q13428 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TCOF1Q13428 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TCOF1Q13428 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TCOF1Q13428 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TCOF1Q13428 SGK3-208ENST00000521198 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TCOF1Q13428 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TCOF1Q13428 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TCOF1Q13428 ANXA5-202ENST00000501272 1363 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TCOF1Q13428 PSMG2-201ENST00000317615 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TCOF1Q13428 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TCOF1Q13428 ZNF436-AS1-201ENST00000335648 2547 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TCOF1Q13428 ADSL-201ENST00000216194 1620 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TCOF1Q13428 FMR1-215ENST00000616382 1648 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TCOF1Q13428 TSPAN3-205ENST00000558745 1340 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TCOF1Q13428 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
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