Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

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Length 394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 AL139339.1-201ENST00000411906 657 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 GHRHR-212ENST00000611037 923 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DUSP4Q13115 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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