Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

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Length 1,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 RPAIN-202ENST00000381208 1394 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRDM2Q13029 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRDM2Q13029 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRDM2Q13029 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRDM2Q13029 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
PRDM2Q13029 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRDM2Q13029 DPPA5-201ENST00000370370 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRDM2Q13029 CASP8-206ENST00000392258 1060 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRDM2Q13029 AC104590.1-201ENST00000560813 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRDM2Q13029 SEPT14P19-201ENST00000587432 336 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRDM2Q13029 CSAG3-201ENST00000599845 844 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRDM2Q13029 PSME2-217ENST00000615264 874 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRDM2Q13029 AC009041.4-201ENST00000620075 638 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
PRDM2Q13029 AC005609.5-201ENST00000624712 1053 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRDM2Q13029 PSME2-218ENST00000630027 185 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRDM2Q13029 LINC02498-201ENST00000635390 1065 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRDM2Q13029 CSAG2-203ENST00000638741 844 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRDM2Q13029 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRDM2Q13029 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRDM2Q13029 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRDM2Q13029 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRDM2Q13029 YPEL4-201ENST00000300022 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRDM2Q13029 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRDM2Q13029 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRDM2Q13029 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRDM2Q13029 TUBB8-206ENST00000568584 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRDM2Q13029 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRDM2Q13029 AL121656.1-201ENST00000440786 482 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRDM2Q13029 OR4A49P-201ENST00000527050 632 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
PRDM2Q13029 MEP1AP1-201ENST00000636082 1097 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
PRDM2Q13029 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRDM2Q13029 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRDM2Q13029 AL590824.1-201ENST00000403828 1349 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
PRDM2Q13029 PRMT2-216ENST00000621201 1301 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRDM2Q13029 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRDM2Q13029 MAGEC3-205ENST00000544766 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRDM2Q13029 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRDM2Q13029 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
PRDM2Q13029 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRDM2Q13029 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRDM2Q13029 SALL2-205ENST00000611430 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRDM2Q13029 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRDM2Q13029 SAPCD1-AS1-202ENST00000419679 461 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRDM2Q13029 B9D1-206ENST00000461069 923 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRDM2Q13029 SMIM15-202ENST00000507416 584 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRDM2Q13029 IFITM2-205ENST00000602569 605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRDM2Q13029 MIR6893-201ENST00000613458 69 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
PRDM2Q13029 PACRG-AS3-203ENST00000614038 1246 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRDM2Q13029 CCDC32-215ENST00000625629 801 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRDM2Q13029 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRDM2Q13029 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRDM2Q13029 NRG1-211ENST00000520502 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRDM2Q13029 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRDM2Q13029 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRDM2Q13029 SDF2-201ENST00000247020 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRDM2Q13029 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRDM2Q13029 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRDM2Q13029 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRDM2Q13029 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRDM2Q13029 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRDM2Q13029 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
PRDM2Q13029 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRDM2Q13029 CCNE2-201ENST00000308108 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRDM2Q13029 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRDM2Q13029 SELENBP1-208ENST00000447402 1530 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRDM2Q13029 RBP4-203ENST00000371469 814 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRDM2Q13029 PITHD1-202ENST00000374524 1292 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRDM2Q13029 MIR632-201ENST00000385193 94 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
PRDM2Q13029 AC002996.1-201ENST00000546840 784 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRDM2Q13029 ABCC6P1-203ENST00000565566 1170 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
PRDM2Q13029 AC005786.2-201ENST00000592368 369 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRDM2Q13029 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRDM2Q13029 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRDM2Q13029 HLF-202ENST00000430986 1385 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRDM2Q13029 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRDM2Q13029 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRDM2Q13029 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRDM2Q13029 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRDM2Q13029 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRDM2Q13029 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRDM2Q13029 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRDM2Q13029 AC233724.9-201ENST00000511694 407 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
PRDM2Q13029 METTL7AP1-201ENST00000547343 496 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
PRDM2Q13029 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRDM2Q13029 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRDM2Q13029 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRDM2Q13029 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRDM2Q13029 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRDM2Q13029 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRDM2Q13029 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRDM2Q13029 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRDM2Q13029 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRDM2Q13029 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRDM2Q13029 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRDM2Q13029 DUOXA1-205ENST00000558422 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRDM2Q13029 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRDM2Q13029 AC015818.1-201ENST00000451011 244 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
PRDM2Q13029 RPL29P2-202ENST00000498671 657 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
PRDM2Q13029 SCAMP5-216ENST00000568081 710 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRDM2Q13029 USE1-207ENST00000596136 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
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