Protein–RNA interactions for Protein: Q12980

NPRL3, GATOR complex protein NPRL3, humanhuman

Predictions only

Length 569 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPRL3Q12980 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NPRL3Q12980 GABRB3-219ENST00000636466 4509 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
NPRL3Q12980 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NPRL3Q12980 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NPRL3Q12980 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
NPRL3Q12980 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
NPRL3Q12980 CCSER2-203ENST00000372088 7657 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
NPRL3Q12980 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
NPRL3Q12980 CCDC57-203ENST00000392343 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NPRL3Q12980 AP1B1-208ENST00000432560 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
NPRL3Q12980 AC004241.5-201ENST00000623870 2448 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
NPRL3Q12980 CSNK1A1P1-201ENST00000430593 2147 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NPRL3Q12980 TGFBR3-204ENST00000465892 2908 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NPRL3Q12980 ATP12A-201ENST00000218548 3732 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NPRL3Q12980 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
NPRL3Q12980 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NPRL3Q12980 ATP2B2-210ENST00000638646 3465 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NPRL3Q12980 PP14571-202ENST00000404891 2017 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NPRL3Q12980 DIS3L2-205ENST00000409401 2048 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NPRL3Q12980 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NPRL3Q12980 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NPRL3Q12980 PRR12-203ENST00000615927 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NPRL3Q12980 NOB1-201ENST00000268802 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NPRL3Q12980 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NPRL3Q12980 TMEM87A-201ENST00000307216 1598 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NPRL3Q12980 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NPRL3Q12980 STK26-202ENST00000394334 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NPRL3Q12980 RBBP8NL-201ENST00000252998 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NPRL3Q12980 VPS9D1-202ENST00000561976 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NPRL3Q12980 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NPRL3Q12980 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NPRL3Q12980 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NPRL3Q12980 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NPRL3Q12980 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NPRL3Q12980 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NPRL3Q12980 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NPRL3Q12980 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NPRL3Q12980 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NPRL3Q12980 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NPRL3Q12980 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
NPRL3Q12980 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NPRL3Q12980 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NPRL3Q12980 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NPRL3Q12980 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NPRL3Q12980 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NPRL3Q12980 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NPRL3Q12980 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
NPRL3Q12980 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
NPRL3Q12980 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
NPRL3Q12980 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NPRL3Q12980 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NPRL3Q12980 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NPRL3Q12980 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NPRL3Q12980 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NPRL3Q12980 CARHSP1-216ENST00000610831 2841 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NPRL3Q12980 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NPRL3Q12980 SAFB-211ENST00000592224 3014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NPRL3Q12980 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NPRL3Q12980 RAPH1-213ENST00000630330 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NPRL3Q12980 AGAP5-201ENST00000374094 2394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NPRL3Q12980 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NPRL3Q12980 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NPRL3Q12980 AP1G2-201ENST00000308724 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NPRL3Q12980 LINC00863-201ENST00000439559 3287 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NPRL3Q12980 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NPRL3Q12980 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NPRL3Q12980 AC072061.1-201ENST00000569710 2234 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
NPRL3Q12980 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NPRL3Q12980 VWA8-201ENST00000281496 3475 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NPRL3Q12980 ATG14-201ENST00000247178 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NPRL3Q12980 AL031595.1-201ENST00000623969 4709 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
NPRL3Q12980 ANKRD20A19P-202ENST00000442969 2796 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NPRL3Q12980 SYT1-204ENST00000457153 4592 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NPRL3Q12980 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NPRL3Q12980 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NPRL3Q12980 LINC01114-203ENST00000425879 2434 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NPRL3Q12980 ERICH6-201ENST00000295910 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NPRL3Q12980 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NPRL3Q12980 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NPRL3Q12980 EPHA5-204ENST00000511294 5176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NPRL3Q12980 ANGPTL2-202ENST00000373425 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NPRL3Q12980 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
NPRL3Q12980 LRSAM1-203ENST00000373322 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NPRL3Q12980 PSIP1-203ENST00000380733 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
NPRL3Q12980 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
NPRL3Q12980 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
NPRL3Q12980 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
NPRL3Q12980 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
NPRL3Q12980 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
NPRL3Q12980 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
NPRL3Q12980 CPNE5-202ENST00000393189 2542 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
NPRL3Q12980 SLC35G1-201ENST00000371408 3490 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NPRL3Q12980 AC019294.4-201ENST00000561777 2905 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
NPRL3Q12980 GOSR2-235ENST00000640269 2190 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NPRL3Q12980 ZDHHC8-203ENST00000405930 3112 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NPRL3Q12980 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
NPRL3Q12980 APBB2-211ENST00000506352 3316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NPRL3Q12980 DDC-207ENST00000444124 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NPRL3Q12980 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NPRL3Q12980 GPT2-201ENST00000340124 3984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms