Protein–RNA interactions for Protein: Q0P6D6

CCDC15, Coiled-coil domain-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC15Q0P6D6 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 CTIF-202ENST00000382998 4407 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 HBP1-212ENST00000485846 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC15Q0P6D6 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 HADH-202ENST00000403312 1752 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 MDM1-203ENST00000393543 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 PTPA-205ENST00000357197 2653 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms