Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CALD1Q05682 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CALD1Q05682 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CALD1Q05682 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CALD1Q05682 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CALD1Q05682 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CALD1Q05682 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CALD1Q05682 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CALD1Q05682 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CALD1Q05682 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CALD1Q05682 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CALD1Q05682 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CALD1Q05682 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CALD1Q05682 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CALD1Q05682 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CALD1Q05682 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CALD1Q05682 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CALD1Q05682 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CALD1Q05682 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CALD1Q05682 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CALD1Q05682 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CALD1Q05682 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CALD1Q05682 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CALD1Q05682 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CALD1Q05682 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CALD1Q05682 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CALD1Q05682 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CALD1Q05682 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CALD1Q05682 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CALD1Q05682 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CALD1Q05682 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CALD1Q05682 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CALD1Q05682 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CALD1Q05682 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CALD1Q05682 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CALD1Q05682 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CALD1Q05682 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CALD1Q05682 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CALD1Q05682 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CALD1Q05682 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CALD1Q05682 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CALD1Q05682 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CALD1Q05682 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CALD1Q05682 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CALD1Q05682 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CALD1Q05682 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CALD1Q05682 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CALD1Q05682 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CALD1Q05682 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CALD1Q05682 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CALD1Q05682 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CALD1Q05682 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CALD1Q05682 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CALD1Q05682 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CALD1Q05682 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CALD1Q05682 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CALD1Q05682 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CALD1Q05682 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CALD1Q05682 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CALD1Q05682 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CALD1Q05682 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CALD1Q05682 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CALD1Q05682 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CALD1Q05682 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CALD1Q05682 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CALD1Q05682 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CALD1Q05682 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CALD1Q05682 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CALD1Q05682 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CALD1Q05682 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CALD1Q05682 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CALD1Q05682 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CALD1Q05682 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CALD1Q05682 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CALD1Q05682 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CALD1Q05682 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CALD1Q05682 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CALD1Q05682 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CALD1Q05682 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CALD1Q05682 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CALD1Q05682 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CALD1Q05682 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CALD1Q05682 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CALD1Q05682 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CALD1Q05682 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CALD1Q05682 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CALD1Q05682 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CALD1Q05682 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CALD1Q05682 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CALD1Q05682 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CALD1Q05682 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CALD1Q05682 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CALD1Q05682 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CALD1Q05682 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CALD1Q05682 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CALD1Q05682 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CALD1Q05682 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CALD1Q05682 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CALD1Q05682 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CALD1Q05682 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms