Protein–RNA interactions for Protein: Q03060

CREM, cAMP-responsive element modulator, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREMQ03060 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CREMQ03060 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CREMQ03060 CHCHD7-202ENST00000355315 1535 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CREMQ03060 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CREMQ03060 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CREMQ03060 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CREMQ03060 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CREMQ03060 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CREMQ03060 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CREMQ03060 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CREMQ03060 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CREMQ03060 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CREMQ03060 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CREMQ03060 APTX-211ENST00000463596 1345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CREMQ03060 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CREMQ03060 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CREMQ03060 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CREMQ03060 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CREMQ03060 HFE-203ENST00000336625 804 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CREMQ03060 TRBJ2-6-201ENST00000390418 53 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CREMQ03060 HLA-DMA-203ENST00000395305 777 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CREMQ03060 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CREMQ03060 AL512306.1-201ENST00000432698 848 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CREMQ03060 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CREMQ03060 LINC01806-201ENST00000436506 765 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CREMQ03060 AC092638.2-201ENST00000441105 947 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CREMQ03060 AP003398.1-201ENST00000531124 318 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CREMQ03060 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CREMQ03060 SMIM6-201ENST00000556126 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CREMQ03060 AL845331.2-201ENST00000561882 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CREMQ03060 AC135782.2-201ENST00000562040 472 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CREMQ03060 AC020659.1-202ENST00000564432 531 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CREMQ03060 RPL17P45-201ENST00000586289 509 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CREMQ03060 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CREMQ03060 AC010422.5-201ENST00000597961 585 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CREMQ03060 SNRPA1-216ENST00000626000 539 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CREMQ03060 CCDC197-205ENST00000636493 1279 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CREMQ03060 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CREMQ03060 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CREMQ03060 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CREMQ03060 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CREMQ03060 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CREMQ03060 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CREMQ03060 SERF2-201ENST00000249786 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CREMQ03060 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CREMQ03060 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CREMQ03060 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CREMQ03060 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CREMQ03060 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CREMQ03060 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CREMQ03060 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CREMQ03060 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CREMQ03060 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CREMQ03060 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CREMQ03060 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CREMQ03060 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CREMQ03060 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CREMQ03060 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CREMQ03060 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CREMQ03060 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CREMQ03060 PDCD5-202ENST00000379316 154 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CREMQ03060 PSMA1-202ENST00000418988 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CREMQ03060 MPC1L-201ENST00000423387 571 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CREMQ03060 AC068134.1-201ENST00000441266 481 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CREMQ03060 AC098934.1-203ENST00000442868 1262 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CREMQ03060 AC018463.1-201ENST00000456674 917 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CREMQ03060 AC092535.3-201ENST00000504969 468 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CREMQ03060 OSMR-AS1-202ENST00000512519 837 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CREMQ03060 AC129102.1-201ENST00000535755 525 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CREMQ03060 AC073573.1-201ENST00000550908 481 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CREMQ03060 TCL1A-205ENST00000555202 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CREMQ03060 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CREMQ03060 PDCD5-208ENST00000592786 468 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CREMQ03060 AP000322.3-201ENST00000608665 388 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CREMQ03060 ZNF596-213ENST00000640035 1163 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CREMQ03060 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CREMQ03060 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CREMQ03060 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CREMQ03060 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CREMQ03060 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CREMQ03060 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CREMQ03060 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CREMQ03060 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CREMQ03060 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CREMQ03060 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CREMQ03060 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CREMQ03060 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CREMQ03060 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
CREMQ03060 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CREMQ03060 HLA-DQB1-202ENST00000399079 1501 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
CREMQ03060 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CREMQ03060 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CREMQ03060 SLC25A19-205ENST00000442286 1496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CREMQ03060 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CREMQ03060 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CREMQ03060 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CREMQ03060 FHL2-206ENST00000408995 1367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CREMQ03060 SERPINB9P1-202ENST00000545177 1375 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CREMQ03060 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CREMQ03060 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.1 ms