Protein–RNA interactions for Protein: Q00403

GTF2B, Transcription initiation factor IIB, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2BQ00403 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GTF2BQ00403 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GTF2BQ00403 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
GTF2BQ00403 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
GTF2BQ00403 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
GTF2BQ00403 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
GTF2BQ00403 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
GTF2BQ00403 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
GTF2BQ00403 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
GTF2BQ00403 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
GTF2BQ00403 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
GTF2BQ00403 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GTF2BQ00403 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GTF2BQ00403 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GTF2BQ00403 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GTF2BQ00403 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GTF2BQ00403 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
GTF2BQ00403 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GTF2BQ00403 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GTF2BQ00403 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GTF2BQ00403 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GTF2BQ00403 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GTF2BQ00403 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GTF2BQ00403 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GTF2BQ00403 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GTF2BQ00403 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
GTF2BQ00403 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GTF2BQ00403 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GTF2BQ00403 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GTF2BQ00403 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GTF2BQ00403 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GTF2BQ00403 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GTF2BQ00403 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GTF2BQ00403 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GTF2BQ00403 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GTF2BQ00403 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GTF2BQ00403 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GTF2BQ00403 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GTF2BQ00403 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GTF2BQ00403 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GTF2BQ00403 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GTF2BQ00403 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GTF2BQ00403 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GTF2BQ00403 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GTF2BQ00403 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GTF2BQ00403 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GTF2BQ00403 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GTF2BQ00403 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GTF2BQ00403 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GTF2BQ00403 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GTF2BQ00403 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GTF2BQ00403 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GTF2BQ00403 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GTF2BQ00403 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GTF2BQ00403 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GTF2BQ00403 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GTF2BQ00403 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GTF2BQ00403 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GTF2BQ00403 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GTF2BQ00403 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GTF2BQ00403 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GTF2BQ00403 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GTF2BQ00403 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GTF2BQ00403 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GTF2BQ00403 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GTF2BQ00403 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GTF2BQ00403 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
GTF2BQ00403 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GTF2BQ00403 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GTF2BQ00403 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GTF2BQ00403 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GTF2BQ00403 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GTF2BQ00403 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
GTF2BQ00403 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
GTF2BQ00403 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GTF2BQ00403 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GTF2BQ00403 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GTF2BQ00403 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
GTF2BQ00403 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
GTF2BQ00403 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
GTF2BQ00403 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GTF2BQ00403 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GTF2BQ00403 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GTF2BQ00403 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GTF2BQ00403 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GTF2BQ00403 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GTF2BQ00403 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GTF2BQ00403 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GTF2BQ00403 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GTF2BQ00403 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GTF2BQ00403 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GTF2BQ00403 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GTF2BQ00403 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GTF2BQ00403 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GTF2BQ00403 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GTF2BQ00403 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GTF2BQ00403 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GTF2BQ00403 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GTF2BQ00403 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GTF2BQ00403 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms