Protein–RNA interactions for Protein: P82094

TMF1, TATA element modulatory factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMF1P82094 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMF1P82094 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMF1P82094 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMF1P82094 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMF1P82094 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMF1P82094 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
TMF1P82094 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMF1P82094 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMF1P82094 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMF1P82094 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMF1P82094 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMF1P82094 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMF1P82094 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMF1P82094 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMF1P82094 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMF1P82094 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
TMF1P82094 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMF1P82094 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMF1P82094 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
TMF1P82094 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMF1P82094 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMF1P82094 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMF1P82094 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMF1P82094 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMF1P82094 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMF1P82094 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMF1P82094 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
TMF1P82094 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMF1P82094 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMF1P82094 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
TMF1P82094 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMF1P82094 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
TMF1P82094 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
TMF1P82094 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
TMF1P82094 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMF1P82094 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
TMF1P82094 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMF1P82094 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMF1P82094 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMF1P82094 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMF1P82094 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMF1P82094 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMF1P82094 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMF1P82094 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMF1P82094 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMF1P82094 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
TMF1P82094 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMF1P82094 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMF1P82094 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMF1P82094 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMF1P82094 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMF1P82094 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMF1P82094 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMF1P82094 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMF1P82094 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMF1P82094 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMF1P82094 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMF1P82094 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMF1P82094 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMF1P82094 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMF1P82094 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMF1P82094 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMF1P82094 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMF1P82094 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMF1P82094 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMF1P82094 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMF1P82094 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMF1P82094 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMF1P82094 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMF1P82094 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
TMF1P82094 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMF1P82094 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
TMF1P82094 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
TMF1P82094 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMF1P82094 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMF1P82094 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMF1P82094 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMF1P82094 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMF1P82094 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMF1P82094 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
TMF1P82094 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMF1P82094 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
TMF1P82094 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
TMF1P82094 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMF1P82094 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMF1P82094 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMF1P82094 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMF1P82094 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMF1P82094 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMF1P82094 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMF1P82094 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMF1P82094 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMF1P82094 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMF1P82094 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMF1P82094 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMF1P82094 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMF1P82094 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMF1P82094 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMF1P82094 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMF1P82094 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms