Protein–RNA interactions for Protein: P80217

IFI35, Interferon-induced 35 kDa protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFI35P80217 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IFI35P80217 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IFI35P80217 SAFB-211ENST00000592224 3014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IFI35P80217 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IFI35P80217 VPS52-212ENST00000445902 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IFI35P80217 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IFI35P80217 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IFI35P80217 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IFI35P80217 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IFI35P80217 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IFI35P80217 USH1C-201ENST00000005226 2700 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IFI35P80217 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IFI35P80217 ATG9A-204ENST00000409422 2512 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IFI35P80217 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IFI35P80217 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IFI35P80217 C7orf57-204ENST00000435376 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IFI35P80217 C7orf57-206ENST00000539619 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IFI35P80217 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IFI35P80217 TRMT2B-203ENST00000372939 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IFI35P80217 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IFI35P80217 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IFI35P80217 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IFI35P80217 TOLLIP-202ENST00000317204 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IFI35P80217 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IFI35P80217 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IFI35P80217 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IFI35P80217 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IFI35P80217 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IFI35P80217 DLL4-201ENST00000249749 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IFI35P80217 APBB1-201ENST00000299402 2636 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IFI35P80217 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IFI35P80217 SLC22A20-202ENST00000525437 3196 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IFI35P80217 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IFI35P80217 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IFI35P80217 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IFI35P80217 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IFI35P80217 MARK1-201ENST00000366917 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IFI35P80217 TGFBR3-204ENST00000465892 2908 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IFI35P80217 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IFI35P80217 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IFI35P80217 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
IFI35P80217 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IFI35P80217 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IFI35P80217 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
IFI35P80217 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IFI35P80217 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
IFI35P80217 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
IFI35P80217 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IFI35P80217 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IFI35P80217 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IFI35P80217 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IFI35P80217 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
IFI35P80217 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IFI35P80217 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IFI35P80217 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IFI35P80217 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IFI35P80217 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IFI35P80217 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IFI35P80217 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IFI35P80217 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IFI35P80217 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IFI35P80217 XG-201ENST00000381174 2315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IFI35P80217 TSEN2-202ENST00000402228 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IFI35P80217 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IFI35P80217 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IFI35P80217 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IFI35P80217 INVS-201ENST00000262456 2968 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IFI35P80217 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IFI35P80217 VWA8-201ENST00000281496 3475 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IFI35P80217 CDHR5-203ENST00000397542 3489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IFI35P80217 ZFYVE27-202ENST00000357540 2765 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IFI35P80217 ZFYVE27-204ENST00000370610 2769 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IFI35P80217 ACTR10-201ENST00000254286 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IFI35P80217 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IFI35P80217 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IFI35P80217 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IFI35P80217 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IFI35P80217 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IFI35P80217 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IFI35P80217 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IFI35P80217 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IFI35P80217 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IFI35P80217 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IFI35P80217 Z82170.1-201ENST00000625081 3192 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
IFI35P80217 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IFI35P80217 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IFI35P80217 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IFI35P80217 SPHK2-201ENST00000245222 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IFI35P80217 CNGA3-204ENST00000409937 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IFI35P80217 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
IFI35P80217 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IFI35P80217 CC2D1B-201ENST00000284376 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IFI35P80217 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IFI35P80217 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IFI35P80217 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IFI35P80217 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IFI35P80217 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IFI35P80217 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IFI35P80217 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IFI35P80217 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81 ms