Protein–RNA interactions for Protein: P68871

HBB, Hemoglobin subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBBP68871 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
HBBP68871 STXBP5L-201ENST00000273666 9496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
HBBP68871 CYB5RL-201ENST00000287899 5777 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
HBBP68871 SERPINI1-201ENST00000295777 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
HBBP68871 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
HBBP68871 RBP3-201ENST00000584701 4276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
HBBP68871 GRHL1-202ENST00000405379 1881 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
HBBP68871 Z98257.2-202ENST00000641138 1548 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
HBBP68871 PRKN-205ENST00000366897 2877 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
HBBP68871 KLHL32-206ENST00000544166 2864 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
HBBP68871 CRY2-212ENST00000616623 4204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
HBBP68871 SMARCA2-209ENST00000382203 5867 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
HBBP68871 TSC22D3-204ENST00000372384 2199 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
HBBP68871 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.93□□□□□ -0.66
HBBP68871 HTR2C-201ENST00000276198 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
HBBP68871 LANCL1-205ENST00000443314 4781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
HBBP68871 ENO2-201ENST00000229277 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
HBBP68871 CICP1-201ENST00000416803 2410 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
HBBP68871 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
HBBP68871 PPP6C-203ENST00000451402 4349 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
HBBP68871 PHF21B-201ENST00000313237 3671 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
HBBP68871 MYADM-201ENST00000336967 3047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
HBBP68871 DNMT1-203ENST00000540357 4916 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
HBBP68871 NUTM2E-202ENST00000602967 3623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
HBBP68871 ING4-201ENST00000341550 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
HBBP68871 SCAF4-201ENST00000286835 4193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
HBBP68871 WTIP-202ENST00000590071 13665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
HBBP68871 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
HBBP68871 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
HBBP68871 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
HBBP68871 DYNC1I2-203ENST00000409197 2572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
HBBP68871 DYNC1I2-206ENST00000409773 2583 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
HBBP68871 LRRC8A-203ENST00000372600 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
HBBP68871 KIAA1614-202ENST00000367588 9654 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
HBBP68871 AC127496.1-201ENST00000576234 3133 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
HBBP68871 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
HBBP68871 KRT33B-201ENST00000251646 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
HBBP68871 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
HBBP68871 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
HBBP68871 GUCY1B3-205ENST00000505764 2456 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
HBBP68871 PLIN3-207ENST00000592528 2154 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
HBBP68871 CCNE2-205ENST00000520509 3330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
HBBP68871 TOR1AIP1-201ENST00000271583 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
HBBP68871 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
HBBP68871 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
HBBP68871 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
HBBP68871 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
HBBP68871 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
HBBP68871 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
HBBP68871 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
HBBP68871 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
HBBP68871 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
HBBP68871 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
HBBP68871 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
HBBP68871 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
HBBP68871 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
HBBP68871 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
HBBP68871 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
HBBP68871 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
HBBP68871 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC10.92□□□□□ -0.66
HBBP68871 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC10.92□□□□□ -0.66
HBBP68871 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
HBBP68871 INHBA-201ENST00000242208 6064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
HBBP68871 PCCB-210ENST00000471595 6090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
HBBP68871 AC125807.2-201ENST00000513358 3514 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
HBBP68871 ITPRIP-201ENST00000278071 6807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
HBBP68871 NFATC1-203ENST00000329101 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
HBBP68871 GIT2-201ENST00000320063 2094 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
HBBP68871 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
HBBP68871 CPT1A-202ENST00000376618 2635 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
HBBP68871 LARGE1-203ENST00000402320 3955 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
HBBP68871 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
HBBP68871 PRPSAP1-206ENST00000446526 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
HBBP68871 SPTSSB-201ENST00000359175 3103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
HBBP68871 PEG10-205ENST00000612748 2585 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
HBBP68871 HOXA7-201ENST00000242159 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
HBBP68871 TRIT1-202ENST00000372818 2034 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
HBBP68871 TMEM164-203ENST00000372072 4975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
HBBP68871 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
HBBP68871 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
HBBP68871 LSM14A-203ENST00000544216 3596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
HBBP68871 SEMA3F-201ENST00000002829 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
HBBP68871 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
HBBP68871 PDHA1-212ENST00000540249 3277 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
HBBP68871 CYTH1-215ENST00000591455 3286 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
HBBP68871 ARID4A-202ENST00000355431 5891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
HBBP68871 ASB2-201ENST00000315988 2743 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
HBBP68871 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
HBBP68871 ITGB2-205ENST00000397850 3178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
HBBP68871 SEMA6D-202ENST00000354744 5931 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
HBBP68871 SLC6A2-201ENST00000219833 2858 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
HBBP68871 IKZF1-203ENST00000346667 5376 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
HBBP68871 AC144450.1-201ENST00000366424 1641 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
HBBP68871 AGAP12P-201ENST00000585227 2359 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
HBBP68871 GRAMD4-201ENST00000361034 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
HBBP68871 PRKAR2A-202ENST00000296446 3318 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
HBBP68871 CACNA1C-231ENST00000616390 2833 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
HBBP68871 PGAP2-203ENST00000396986 1837 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
HBBP68871 F2-205ENST00000530231 1849 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
HBBP68871 KCNJ5-202ENST00000529694 5940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 151.5 ms