Protein–RNA interactions for Protein: P63121

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pro protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63121 SPTSSB-201ENST00000359175 3103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 TNN-202ENST00000621086 4234 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 KCNAB2-219ENST00000602612 2396 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 MARK1-201ENST00000366917 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 TGFBR3-204ENST00000465892 2908 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 RPL31-207ENST00000409711 2328 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 PASK-203ENST00000403638 5161 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 POU5F2-201ENST00000606183 8418 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 FANCC-210ENST00000490972 2709 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 EOGT-202ENST00000383701 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 TRHDE-AS1-201ENST00000426250 3684 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 DHX38-201ENST00000268482 4608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 LRSAM1-204ENST00000373324 3044 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 UQCRFS1-201ENST00000304863 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 PLD1-201ENST00000331659 2906 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 CR382287.2-201ENST00000623370 1942 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 TMPRSS13-202ENST00000445164 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 MAP7-201ENST00000354570 4152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 GRIN1-207ENST00000371560 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 EMILIN1-201ENST00000380320 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 SNRK-201ENST00000296088 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 GRM4-203ENST00000455714 2574 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 RBP3-201ENST00000584701 4276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 SP6-202ENST00000536300 3848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 SPATA13-203ENST00000382108 8463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 KDM8-212ENST00000568965 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 WAPL-206ENST00000618527 6152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 RAB37-202ENST00000392610 2858 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 PRKCE-201ENST00000306156 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 RRBP1-201ENST00000246043 4737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 LDB3-209ENST00000623056 2314 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 FAM118A-201ENST00000216214 3458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 URGCP-201ENST00000336086 5658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 GRIN1-202ENST00000371546 4114 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 AFDN-206ENST00000392112 7459 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 SLC4A7-211ENST00000445684 4061 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 MYT1-201ENST00000328439 5535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 TLR6-202ENST00000436693 5880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 RBM6-211ENST00000443081 4010 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 SYNE3-201ENST00000334258 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 CPLX2-201ENST00000359546 5023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 BRD1-201ENST00000216267 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 CSNK1G3-201ENST00000345990 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 CILP-201ENST00000261883 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 CMIP-208ENST00000566462 3512 ntTSL 4 BASIC10.16□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 ABR-202ENST00000302538 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 CLCN4-201ENST00000380829 2418 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
HERVK_113P63121 KRT36-202ENST00000393986 1707 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.6 ms