Protein–RNA interactions for Protein: P49279

SLC11A1, Natural resistance-associated macrophage protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC11A1P49279 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC11A1P49279 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC11A1P49279 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC11A1P49279 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC11A1P49279 AC006372.4-201ENST00000624122 1543 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC11A1P49279 CNR1-201ENST00000362094 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC11A1P49279 MAPK13-202ENST00000373759 1036 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC11A1P49279 MAPK3-204ENST00000395200 997 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC11A1P49279 AC012442.2-201ENST00000414784 425 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC11A1P49279 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC11A1P49279 AL592301.1-201ENST00000439501 864 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC11A1P49279 ERP29P1-201ENST00000442902 706 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC11A1P49279 AC084030.1-201ENST00000455068 561 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC11A1P49279 AC108199.1-201ENST00000504249 508 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC11A1P49279 SNCB-203ENST00000506696 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC11A1P49279 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC11A1P49279 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC11A1P49279 ZNF530-203ENST00000597864 634 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC11A1P49279 HIST1H2BE-201ENST00000614097 497 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC11A1P49279 RPS10-207ENST00000621356 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC11A1P49279 KRT33A-201ENST00000007735 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC11A1P49279 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC11A1P49279 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC11A1P49279 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC11A1P49279 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC11A1P49279 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC11A1P49279 EDNRB-204ENST00000626030 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC11A1P49279 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC11A1P49279 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC11A1P49279 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC11A1P49279 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC11A1P49279 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC11A1P49279 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC11A1P49279 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC11A1P49279 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC11A1P49279 AC090502.4-201ENST00000551714 1386 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC11A1P49279 CNBP-201ENST00000422453 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC11A1P49279 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC11A1P49279 ATF4-202ENST00000396680 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC11A1P49279 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC11A1P49279 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC11A1P49279 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC11A1P49279 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC11A1P49279 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC11A1P49279 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC11A1P49279 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC11A1P49279 RARS2-201ENST00000369536 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC11A1P49279 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC11A1P49279 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC11A1P49279 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC11A1P49279 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC11A1P49279 CMTM5-201ENST00000339180 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC11A1P49279 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC11A1P49279 EVA1A-204ENST00000410071 777 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC11A1P49279 AC011247.2-201ENST00000457097 233 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC11A1P49279 TXNRD2-206ENST00000462330 1129 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC11A1P49279 RNA5SP417-201ENST00000516459 108 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC11A1P49279 MAFTRR-203ENST00000567993 685 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC11A1P49279 RN7SL665P-201ENST00000578793 300 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC11A1P49279 AL132780.4-201ENST00000624870 1135 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC11A1P49279 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC11A1P49279 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC11A1P49279 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC11A1P49279 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC11A1P49279 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC11A1P49279 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC11A1P49279 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC11A1P49279 AC010096.1-201ENST00000443897 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC11A1P49279 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC11A1P49279 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC11A1P49279 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC11A1P49279 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC11A1P49279 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC11A1P49279 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC11A1P49279 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SLC11A1P49279 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC11A1P49279 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC11A1P49279 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC11A1P49279 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC11A1P49279 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC11A1P49279 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC11A1P49279 ASB15-207ENST00000540573 1651 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC11A1P49279 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC11A1P49279 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC11A1P49279 LIMS1-201ENST00000332345 1235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC11A1P49279 BAX-205ENST00000391871 687 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC11A1P49279 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC11A1P49279 PTTG1IP-202ENST00000397886 755 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC11A1P49279 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC11A1P49279 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC11A1P49279 AL137058.1-201ENST00000418237 673 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC11A1P49279 AC004837.1-201ENST00000446267 564 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC11A1P49279 AC112487.1-201ENST00000498032 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC11A1P49279 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC11A1P49279 MPZL3-203ENST00000525386 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC11A1P49279 LINC01154-201ENST00000548617 454 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC11A1P49279 AC090825.1-202ENST00000560059 665 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC11A1P49279 MIR2392-201ENST00000584881 84 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC11A1P49279 SIGLEC22P-201ENST00000599104 714 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC11A1P49279 IRF3-225ENST00000600022 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms