Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NESP48681 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NESP48681 SMIM4-201ENST00000307106 274 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NESP48681 FAM86FP-201ENST00000338711 969 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
NESP48681 SPTLC1P3-201ENST00000403408 259 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
NESP48681 INMT-202ENST00000409539 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NESP48681 RFNG-202ENST00000429557 994 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NESP48681 COQ10BP2-201ENST00000513804 724 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
NESP48681 TSPAN9-IT1-201ENST00000539784 562 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NESP48681 METTL7AP1-201ENST00000547343 496 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
NESP48681 MSRB1-205ENST00000564908 550 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NESP48681 AC010319.2-201ENST00000594663 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NESP48681 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NESP48681 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NESP48681 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NESP48681 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NESP48681 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NESP48681 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NESP48681 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NESP48681 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NESP48681 MEFV-203ENST00000536379 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NESP48681 BCL2L11-203ENST00000357757 947 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NESP48681 RPLP1-202ENST00000357790 445 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NESP48681 ACOT6-201ENST00000381139 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NESP48681 Z69733.1-201ENST00000445990 632 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NESP48681 PRSS55-203ENST00000522210 1005 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NESP48681 ABCC6P2-201ENST00000526069 590 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
NESP48681 SLC25A3-206ENST00000547534 556 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NESP48681 LINC00514-203ENST00000573465 313 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NESP48681 AC005332.2-201ENST00000590010 930 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
NESP48681 Metazoa_SRP.153-201ENST00000620153 341 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
NESP48681 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NESP48681 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NESP48681 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NESP48681 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NESP48681 AKIP1-203ENST00000309377 1327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NESP48681 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NESP48681 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NESP48681 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NESP48681 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NESP48681 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NESP48681 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NESP48681 RBP4-203ENST00000371469 814 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NESP48681 AP000959.1-201ENST00000441759 977 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NESP48681 AC079250.1-201ENST00000456046 531 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
NESP48681 AC139493.2-202ENST00000510155 544 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NESP48681 AC026310.2-201ENST00000546353 728 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NESP48681 AL136298.3-201ENST00000556746 445 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
NESP48681 COG6-212ENST00000630730 186 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NESP48681 ADORA3-204ENST00000632535 1201 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NESP48681 AC137936.2-202ENST00000638124 1146 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NESP48681 PHTF2-204ENST00000415251 1738 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NESP48681 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NESP48681 STK16-202ENST00000409260 1493 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NESP48681 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NESP48681 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NESP48681 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NESP48681 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NESP48681 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NESP48681 PLA2G2A-201ENST00000375111 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NESP48681 MIR193A-201ENST00000384882 88 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
NESP48681 HNRNPA1P59-201ENST00000430583 918 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
NESP48681 AL390961.2-201ENST00000454991 472 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NESP48681 HAND2-AS1-208ENST00000504740 837 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NESP48681 AC078923.1-201ENST00000552856 748 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NESP48681 AL078624.1-201ENST00000604004 547 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
NESP48681 DUX4L33-201ENST00000635217 958 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
NESP48681 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NESP48681 TMEM74B-201ENST00000381894 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NESP48681 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NESP48681 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NESP48681 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
NESP48681 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NESP48681 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
NESP48681 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NESP48681 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NESP48681 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NESP48681 PROZ-201ENST00000342783 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NESP48681 IGHV3-11-201ENST00000390601 473 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NESP48681 APOBEC3B-204ENST00000407298 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NESP48681 AC092865.2-201ENST00000439409 971 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
NESP48681 GIMAP6-202ENST00000493969 876 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NESP48681 AP002495.1-205ENST00000529513 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NESP48681 AC008982.2-201ENST00000600473 493 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NESP48681 PAX6-238ENST00000638755 1161 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NESP48681 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NESP48681 HRH2-202ENST00000377291 2561 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NESP48681 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NESP48681 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NESP48681 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NESP48681 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NESP48681 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NESP48681 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NESP48681 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NESP48681 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NESP48681 TPM2-204ENST00000378300 1771 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NESP48681 NR1H4-203ENST00000392986 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NESP48681 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NESP48681 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NESP48681 Z82195.2-202ENST00000458525 1646 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms