Protein–RNA interactions for Protein: P38117

ETFB, Electron transfer flavoprotein subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETFBP38117 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ETFBP38117 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ETFBP38117 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ETFBP38117 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ETFBP38117 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ETFBP38117 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ETFBP38117 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ETFBP38117 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ETFBP38117 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ETFBP38117 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ETFBP38117 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ETFBP38117 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ETFBP38117 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ETFBP38117 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ETFBP38117 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ETFBP38117 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ETFBP38117 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
ETFBP38117 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ETFBP38117 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ETFBP38117 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ETFBP38117 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ETFBP38117 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ETFBP38117 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ETFBP38117 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ETFBP38117 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ETFBP38117 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ETFBP38117 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ETFBP38117 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ETFBP38117 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ETFBP38117 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ETFBP38117 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ETFBP38117 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ETFBP38117 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
ETFBP38117 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ETFBP38117 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
ETFBP38117 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
ETFBP38117 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ETFBP38117 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ETFBP38117 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ETFBP38117 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ETFBP38117 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ETFBP38117 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ETFBP38117 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ETFBP38117 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ETFBP38117 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ETFBP38117 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ETFBP38117 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ETFBP38117 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ETFBP38117 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ETFBP38117 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ETFBP38117 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ETFBP38117 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ETFBP38117 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ETFBP38117 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ETFBP38117 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ETFBP38117 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ETFBP38117 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ETFBP38117 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ETFBP38117 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ETFBP38117 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ETFBP38117 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ETFBP38117 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ETFBP38117 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ETFBP38117 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ETFBP38117 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ETFBP38117 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ETFBP38117 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
ETFBP38117 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ETFBP38117 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ETFBP38117 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ETFBP38117 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ETFBP38117 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ETFBP38117 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ETFBP38117 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ETFBP38117 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ETFBP38117 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ETFBP38117 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
ETFBP38117 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ETFBP38117 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ETFBP38117 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ETFBP38117 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ETFBP38117 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ETFBP38117 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ETFBP38117 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ETFBP38117 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ETFBP38117 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ETFBP38117 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ETFBP38117 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ETFBP38117 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ETFBP38117 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ETFBP38117 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ETFBP38117 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ETFBP38117 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ETFBP38117 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ETFBP38117 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ETFBP38117 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ETFBP38117 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ETFBP38117 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ETFBP38117 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ETFBP38117 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms