Protein–RNA interactions for Protein: P36941

LTBR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, humanhuman

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Length 435 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBRP36941 HMGCLL1-203ENST00000370850 1171 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LTBRP36941 TSC22D3-202ENST00000372382 1216 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LTBRP36941 IGHV1-3-201ENST00000390595 395 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LTBRP36941 OR2W2P-201ENST00000406313 909 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
LTBRP36941 AC002127.2-201ENST00000444032 792 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LTBRP36941 SMUG1-221ENST00000514196 553 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LTBRP36941 AC073569.2-201ENST00000551995 354 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LTBRP36941 MT3-202ENST00000561640 514 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LTBRP36941 AC087741.1-204ENST00000573935 646 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LTBRP36941 KLKP1-202ENST00000597246 1125 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LTBRP36941 PRMT1P1-201ENST00000604252 1009 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
LTBRP36941 AC092073.1-202ENST00000606020 653 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LTBRP36941 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
LTBRP36941 AP000356.3-203ENST00000614808 601 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LTBRP36941 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LTBRP36941 TMEM9B-202ENST00000525069 1433 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LTBRP36941 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LTBRP36941 CHRNA2-201ENST00000240132 1735 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LTBRP36941 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LTBRP36941 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
LTBRP36941 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
LTBRP36941 MAD2L1BP-202ENST00000451025 1517 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
LTBRP36941 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
LTBRP36941 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
LTBRP36941 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
LTBRP36941 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LTBRP36941 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LTBRP36941 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LTBRP36941 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LTBRP36941 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LTBRP36941 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LTBRP36941 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LTBRP36941 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LTBRP36941 CHI3L1-201ENST00000255409 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LTBRP36941 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LTBRP36941 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LTBRP36941 GOLGA8UP-201ENST00000527159 1755 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
LTBRP36941 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LTBRP36941 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
LTBRP36941 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LTBRP36941 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LTBRP36941 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LTBRP36941 MORN2-201ENST00000340556 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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LTBRP36941 LINC00303-203ENST00000427799 1028 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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LTBRP36941 AC010531.8-201ENST00000623341 685 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
LTBRP36941 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LTBRP36941 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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LTBRP36941 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LTBRP36941 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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LTBRP36941 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LTBRP36941 ALDOA-204ENST00000412304 1603 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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LTBRP36941 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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LTBRP36941 METTL6-202ENST00000383790 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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LTBRP36941 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LTBRP36941 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LTBRP36941 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LTBRP36941 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LTBRP36941 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LTBRP36941 CCL19-201ENST00000311925 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LTBRP36941 CCL25-202ENST00000315626 450 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LTBRP36941 KRTAP2-3-201ENST00000391418 875 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LTBRP36941 ABCD1P4-201ENST00000399687 604 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
LTBRP36941 VPREB1-202ENST00000403807 755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LTBRP36941 AHCYP3-201ENST00000420053 1279 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
LTBRP36941 TXNL4B-203ENST00000426362 965 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LTBRP36941 ARSEP1-202ENST00000430152 499 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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LTBRP36941 URB1-AS1-201ENST00000534991 831 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
LTBRP36941 C12orf57-204ENST00000540506 551 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LTBRP36941 SPAG5-AS1-204ENST00000556050 871 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LTBRP36941 OR2T11-201ENST00000625105 1072 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LTBRP36941 IL18BP-205ENST00000393705 1549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LTBRP36941 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LTBRP36941 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
LTBRP36941 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LTBRP36941 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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