Protein–RNA interactions for Protein: P35221

CTNNA1, Catenin alpha-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA1P35221 TMEM132C-201ENST00000435159 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTNNA1P35221 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTNNA1P35221 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTNNA1P35221 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTNNA1P35221 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTNNA1P35221 TPM3P9-201ENST00000424846 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTNNA1P35221 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTNNA1P35221 NRIP3-201ENST00000309166 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTNNA1P35221 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTNNA1P35221 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTNNA1P35221 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTNNA1P35221 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CTNNA1P35221 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CTNNA1P35221 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTNNA1P35221 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CTNNA1P35221 SREBF1-202ENST00000355815 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTNNA1P35221 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTNNA1P35221 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTNNA1P35221 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTNNA1P35221 ACSM2A-209ENST00000573854 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTNNA1P35221 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTNNA1P35221 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTNNA1P35221 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTNNA1P35221 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTNNA1P35221 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTNNA1P35221 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTNNA1P35221 SLC39A8-203ENST00000424970 4032 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTNNA1P35221 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTNNA1P35221 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTNNA1P35221 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTNNA1P35221 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTNNA1P35221 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTNNA1P35221 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CTNNA1P35221 PRR12-203ENST00000615927 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTNNA1P35221 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTNNA1P35221 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CTNNA1P35221 RPS6KC1-208ENST00000614059 4188 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTNNA1P35221 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTNNA1P35221 PELP1-202ENST00000436683 3524 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTNNA1P35221 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTNNA1P35221 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTNNA1P35221 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTNNA1P35221 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTNNA1P35221 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CTNNA1P35221 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTNNA1P35221 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CTNNA1P35221 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTNNA1P35221 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTNNA1P35221 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CTNNA1P35221 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CTNNA1P35221 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CTNNA1P35221 TET3-201ENST00000305799 5174 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTNNA1P35221 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTNNA1P35221 GPT2-201ENST00000340124 3984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTNNA1P35221 FZD6-206ENST00000523739 2774 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTNNA1P35221 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTNNA1P35221 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTNNA1P35221 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTNNA1P35221 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTNNA1P35221 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTNNA1P35221 MROH2A-201ENST00000389758 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTNNA1P35221 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTNNA1P35221 SF1-201ENST00000227503 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTNNA1P35221 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTNNA1P35221 ZNF395-201ENST00000344423 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTNNA1P35221 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CTNNA1P35221 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTNNA1P35221 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTNNA1P35221 TSPEAR-AS2-202ENST00000354333 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTNNA1P35221 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CTNNA1P35221 AP001062.1-201ENST00000448927 4354 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTNNA1P35221 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTNNA1P35221 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTNNA1P35221 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTNNA1P35221 LRSAM1-204ENST00000373324 3044 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTNNA1P35221 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTNNA1P35221 TRIM10-204ENST00000449742 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTNNA1P35221 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTNNA1P35221 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTNNA1P35221 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTNNA1P35221 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTNNA1P35221 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTNNA1P35221 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTNNA1P35221 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CTNNA1P35221 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTNNA1P35221 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTNNA1P35221 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CTNNA1P35221 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CTNNA1P35221 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTNNA1P35221 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTNNA1P35221 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTNNA1P35221 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTNNA1P35221 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTNNA1P35221 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTNNA1P35221 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CTNNA1P35221 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTNNA1P35221 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTNNA1P35221 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTNNA1P35221 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTNNA1P35221 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms