Protein–RNA interactions for Protein: P26232

CTNNA2, Catenin alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA2P26232 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTNNA2P26232 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTNNA2P26232 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTNNA2P26232 FLNA-201ENST00000344736 7932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTNNA2P26232 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTNNA2P26232 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTNNA2P26232 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTNNA2P26232 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTNNA2P26232 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTNNA2P26232 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTNNA2P26232 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTNNA2P26232 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTNNA2P26232 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTNNA2P26232 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CTNNA2P26232 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTNNA2P26232 PLXNB1-201ENST00000296440 7143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTNNA2P26232 RPS6KC1-206ENST00000543354 4082 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTNNA2P26232 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTNNA2P26232 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTNNA2P26232 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTNNA2P26232 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTNNA2P26232 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CTNNA2P26232 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTNNA2P26232 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTNNA2P26232 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTNNA2P26232 LAMB2-201ENST00000305544 5643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTNNA2P26232 DDX3X-201ENST00000399959 5399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTNNA2P26232 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTNNA2P26232 MBP-205ENST00000397860 4844 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTNNA2P26232 TP73-211ENST00000604074 4806 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTNNA2P26232 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTNNA2P26232 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTNNA2P26232 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTNNA2P26232 BTRC-203ENST00000393441 6084 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTNNA2P26232 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTNNA2P26232 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTNNA2P26232 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTNNA2P26232 AC002407.1-201ENST00000636668 3863 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTNNA2P26232 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTNNA2P26232 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTNNA2P26232 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTNNA2P26232 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTNNA2P26232 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTNNA2P26232 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CTNNA2P26232 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTNNA2P26232 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTNNA2P26232 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTNNA2P26232 GAB2-202ENST00000361507 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTNNA2P26232 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CTNNA2P26232 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTNNA2P26232 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CTNNA2P26232 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTNNA2P26232 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CTNNA2P26232 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTNNA2P26232 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CTNNA2P26232 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CTNNA2P26232 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTNNA2P26232 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CTNNA2P26232 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTNNA2P26232 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTNNA2P26232 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTNNA2P26232 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTNNA2P26232 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTNNA2P26232 OCRL-201ENST00000357121 5138 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTNNA2P26232 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTNNA2P26232 OR2C3-204ENST00000641802 8509 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTNNA2P26232 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTNNA2P26232 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTNNA2P26232 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTNNA2P26232 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTNNA2P26232 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTNNA2P26232 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTNNA2P26232 TNFAIP8L1-202ENST00000536716 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTNNA2P26232 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTNNA2P26232 CAMK2B-217ENST00000457475 4142 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTNNA2P26232 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTNNA2P26232 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTNNA2P26232 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTNNA2P26232 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTNNA2P26232 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTNNA2P26232 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTNNA2P26232 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTNNA2P26232 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTNNA2P26232 NEK9-201ENST00000238616 8310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTNNA2P26232 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTNNA2P26232 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTNNA2P26232 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTNNA2P26232 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTNNA2P26232 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTNNA2P26232 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTNNA2P26232 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTNNA2P26232 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTNNA2P26232 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTNNA2P26232 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTNNA2P26232 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTNNA2P26232 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTNNA2P26232 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTNNA2P26232 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTNNA2P26232 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTNNA2P26232 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms