Protein–RNA interactions for Protein: P23109

AMPD1, AMP deaminase 1, humanhuman

Predictions only

Length 780 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMPD1P23109 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AMPD1P23109 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AMPD1P23109 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AMPD1P23109 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AMPD1P23109 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AMPD1P23109 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AMPD1P23109 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AMPD1P23109 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AMPD1P23109 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AMPD1P23109 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AMPD1P23109 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AMPD1P23109 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AMPD1P23109 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AMPD1P23109 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AMPD1P23109 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AMPD1P23109 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AMPD1P23109 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AMPD1P23109 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AMPD1P23109 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AMPD1P23109 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
AMPD1P23109 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AMPD1P23109 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AMPD1P23109 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AMPD1P23109 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AMPD1P23109 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AMPD1P23109 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AMPD1P23109 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AMPD1P23109 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AMPD1P23109 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AMPD1P23109 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
AMPD1P23109 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AMPD1P23109 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AMPD1P23109 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AMPD1P23109 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AMPD1P23109 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
AMPD1P23109 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AMPD1P23109 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AMPD1P23109 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
AMPD1P23109 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
AMPD1P23109 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
AMPD1P23109 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
AMPD1P23109 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AMPD1P23109 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AMPD1P23109 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AMPD1P23109 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AMPD1P23109 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AMPD1P23109 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
AMPD1P23109 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AMPD1P23109 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AMPD1P23109 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AMPD1P23109 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AMPD1P23109 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AMPD1P23109 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AMPD1P23109 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AMPD1P23109 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AMPD1P23109 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AMPD1P23109 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AMPD1P23109 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AMPD1P23109 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AMPD1P23109 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AMPD1P23109 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AMPD1P23109 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AMPD1P23109 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AMPD1P23109 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AMPD1P23109 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AMPD1P23109 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AMPD1P23109 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AMPD1P23109 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AMPD1P23109 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AMPD1P23109 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AMPD1P23109 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AMPD1P23109 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AMPD1P23109 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AMPD1P23109 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AMPD1P23109 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AMPD1P23109 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AMPD1P23109 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AMPD1P23109 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AMPD1P23109 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AMPD1P23109 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AMPD1P23109 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AMPD1P23109 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AMPD1P23109 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AMPD1P23109 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AMPD1P23109 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
AMPD1P23109 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AMPD1P23109 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
AMPD1P23109 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AMPD1P23109 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AMPD1P23109 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
AMPD1P23109 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AMPD1P23109 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AMPD1P23109 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AMPD1P23109 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
AMPD1P23109 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AMPD1P23109 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
AMPD1P23109 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AMPD1P23109 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AMPD1P23109 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AMPD1P23109 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.8 ms