Protein–RNA interactions for Protein: P22670

RFX1, MHC class II regulatory factor RFX1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX1P22670 ANK1-205ENST00000347528 8237 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RFX1P22670 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RFX1P22670 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RFX1P22670 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RFX1P22670 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RFX1P22670 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RFX1P22670 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RFX1P22670 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RFX1P22670 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RFX1P22670 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RFX1P22670 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RFX1P22670 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RFX1P22670 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RFX1P22670 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RFX1P22670 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RFX1P22670 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RFX1P22670 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RFX1P22670 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RFX1P22670 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RFX1P22670 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RFX1P22670 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RFX1P22670 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RFX1P22670 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RFX1P22670 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RFX1P22670 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RFX1P22670 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RFX1P22670 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RFX1P22670 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RFX1P22670 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RFX1P22670 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RFX1P22670 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RFX1P22670 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RFX1P22670 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RFX1P22670 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RFX1P22670 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RFX1P22670 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RFX1P22670 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RFX1P22670 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RFX1P22670 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RFX1P22670 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RFX1P22670 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RFX1P22670 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RFX1P22670 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RFX1P22670 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RFX1P22670 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RFX1P22670 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RFX1P22670 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RFX1P22670 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RFX1P22670 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RFX1P22670 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RFX1P22670 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RFX1P22670 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RFX1P22670 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RFX1P22670 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RFX1P22670 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RFX1P22670 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RFX1P22670 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RFX1P22670 SIX4-201ENST00000216513 6285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RFX1P22670 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RFX1P22670 SPECC1L-ADORA2A-201ENST00000358654 6204 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RFX1P22670 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RFX1P22670 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RFX1P22670 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RFX1P22670 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RFX1P22670 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RFX1P22670 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RFX1P22670 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RFX1P22670 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RFX1P22670 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RFX1P22670 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RFX1P22670 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RFX1P22670 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RFX1P22670 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RFX1P22670 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RFX1P22670 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RFX1P22670 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RFX1P22670 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RFX1P22670 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RFX1P22670 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RFX1P22670 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RFX1P22670 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RFX1P22670 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RFX1P22670 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RFX1P22670 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RFX1P22670 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RFX1P22670 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RFX1P22670 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RFX1P22670 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RFX1P22670 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RFX1P22670 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RFX1P22670 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RFX1P22670 GRIK4-202ENST00000438375 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RFX1P22670 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RFX1P22670 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RFX1P22670 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RFX1P22670 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RFX1P22670 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RFX1P22670 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RFX1P22670 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RFX1P22670 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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