Protein–RNA interactions for Protein: P13994

CCDC130, Coiled-coil domain-containing protein 130, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC130P13994 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC130P13994 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC130P13994 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC130P13994 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC130P13994 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC130P13994 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC130P13994 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC130P13994 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC130P13994 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC130P13994 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC130P13994 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC130P13994 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC130P13994 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC130P13994 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC130P13994 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC130P13994 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC130P13994 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC130P13994 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC130P13994 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC130P13994 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC130P13994 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC130P13994 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC130P13994 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC130P13994 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC130P13994 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC130P13994 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC130P13994 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC130P13994 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC130P13994 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC130P13994 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC130P13994 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC130P13994 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC130P13994 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC130P13994 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC130P13994 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC130P13994 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC130P13994 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC130P13994 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC130P13994 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC130P13994 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC130P13994 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC130P13994 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC130P13994 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC130P13994 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC130P13994 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC130P13994 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC130P13994 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC130P13994 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC130P13994 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC130P13994 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC130P13994 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC130P13994 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC130P13994 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC130P13994 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC130P13994 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC130P13994 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC130P13994 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC130P13994 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC130P13994 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC130P13994 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC130P13994 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC130P13994 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC130P13994 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCDC130P13994 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCDC130P13994 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCDC130P13994 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCDC130P13994 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCDC130P13994 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC130P13994 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC130P13994 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC130P13994 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC130P13994 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC130P13994 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC130P13994 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC130P13994 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC130P13994 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC130P13994 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC130P13994 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC130P13994 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC130P13994 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC130P13994 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC130P13994 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC130P13994 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC130P13994 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC130P13994 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC130P13994 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC130P13994 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC130P13994 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC130P13994 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC130P13994 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC130P13994 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC130P13994 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC130P13994 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC130P13994 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC130P13994 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC130P13994 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC130P13994 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC130P13994 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC130P13994 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC130P13994 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms