Protein–RNA interactions for Protein: P11047

LAMC1, Laminin subunit gamma-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC1P11047 AL451007.2-201ENST00000632004 563 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
LAMC1P11047 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LAMC1P11047 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LAMC1P11047 RNF145-202ENST00000424310 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LAMC1P11047 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LAMC1P11047 KCTD6-202ENST00000404589 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LAMC1P11047 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LAMC1P11047 SEC13-202ENST00000350697 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LAMC1P11047 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LAMC1P11047 DPEP2-202ENST00000393847 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LAMC1P11047 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LAMC1P11047 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LAMC1P11047 CHIT1-201ENST00000255427 1598 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LAMC1P11047 AL672207.1-201ENST00000328462 1570 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
LAMC1P11047 CHRNA1-204ENST00000409323 1585 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LAMC1P11047 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LAMC1P11047 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LAMC1P11047 IQCJ-201ENST00000397832 1460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LAMC1P11047 AC007952.5-201ENST00000572818 1486 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
LAMC1P11047 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LAMC1P11047 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LAMC1P11047 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LAMC1P11047 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LAMC1P11047 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LAMC1P11047 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LAMC1P11047 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LAMC1P11047 CHTF8-202ENST00000398235 1073 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LAMC1P11047 GULP1-204ENST00000409637 1242 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LAMC1P11047 ID2-AS1-201ENST00000412712 953 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LAMC1P11047 FRMD4A-204ENST00000475141 1233 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LAMC1P11047 COX5A-205ENST00000568517 582 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LAMC1P11047 AC011444.1-201ENST00000587836 639 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LAMC1P11047 AL356417.2-202ENST00000608986 532 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LAMC1P11047 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LAMC1P11047 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LAMC1P11047 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LAMC1P11047 GPD1-205ENST00000548814 1591 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LAMC1P11047 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LAMC1P11047 ING4-207ENST00000446105 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LAMC1P11047 FXYD3-208ENST00000604404 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LAMC1P11047 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LAMC1P11047 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LAMC1P11047 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LAMC1P11047 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LAMC1P11047 FAM96A-203ENST00000557835 1536 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LAMC1P11047 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LAMC1P11047 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LAMC1P11047 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
LAMC1P11047 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LAMC1P11047 C19orf18-201ENST00000314391 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LAMC1P11047 GDPGP1-201ENST00000329600 1193 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
LAMC1P11047 AC112721.1-201ENST00000409162 588 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
LAMC1P11047 AC108734.2-201ENST00000420887 1069 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
LAMC1P11047 PRB3-202ENST00000538488 1283 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
LAMC1P11047 AL118522.1-201ENST00000611368 560 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
LAMC1P11047 RPL13A-213ENST00000621674 1098 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
LAMC1P11047 TPM4-202ENST00000344824 1417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
LAMC1P11047 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LAMC1P11047 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
LAMC1P11047 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
LAMC1P11047 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LAMC1P11047 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LAMC1P11047 TUBB4AP1-201ENST00000450755 1325 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
LAMC1P11047 GOT2-202ENST00000434819 1615 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
LAMC1P11047 ODCP-201ENST00000459650 1639 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
LAMC1P11047 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LAMC1P11047 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LAMC1P11047 FAM86C1-201ENST00000346333 2010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LAMC1P11047 CLTCL1-212ENST00000622493 1714 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LAMC1P11047 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LAMC1P11047 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LAMC1P11047 HIST1H1D-201ENST00000244534 666 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LAMC1P11047 CCL19-201ENST00000311925 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LAMC1P11047 POLR2L-201ENST00000322028 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LAMC1P11047 LY86-202ENST00000379953 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LAMC1P11047 NME4-203ENST00000397722 1232 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LAMC1P11047 ACTG1P19-201ENST00000418987 1116 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
LAMC1P11047 FTCDNL1-203ENST00000420922 772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LAMC1P11047 PSMB8-AS1-204ENST00000429600 996 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LAMC1P11047 AC006529.1-201ENST00000459978 637 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
LAMC1P11047 AC108474.1-201ENST00000507776 421 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LAMC1P11047 ZNF879-202ENST00000519896 543 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LAMC1P11047 LINC01569-203ENST00000573268 694 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LAMC1P11047 SNORD3B-1-201ENST00000577988 758 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
LAMC1P11047 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LAMC1P11047 TADA3-204ENST00000440161 1617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LAMC1P11047 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LAMC1P11047 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LAMC1P11047 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LAMC1P11047 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LAMC1P11047 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LAMC1P11047 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LAMC1P11047 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LAMC1P11047 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LAMC1P11047 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LAMC1P11047 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LAMC1P11047 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
LAMC1P11047 SHMT2-203ENST00000449049 2121 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LAMC1P11047 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LAMC1P11047 TARBP2-202ENST00000394357 1402 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 272.1 ms