Protein–RNA interactions for Protein: P02545

LMNA, Prelamin-A/C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNAP02545 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LMNAP02545 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LMNAP02545 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LMNAP02545 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LMNAP02545 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LMNAP02545 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LMNAP02545 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LMNAP02545 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LMNAP02545 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LMNAP02545 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LMNAP02545 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LMNAP02545 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LMNAP02545 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LMNAP02545 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LMNAP02545 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LMNAP02545 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LMNAP02545 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMNAP02545 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMNAP02545 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMNAP02545 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMNAP02545 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMNAP02545 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMNAP02545 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMNAP02545 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMNAP02545 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMNAP02545 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMNAP02545 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMNAP02545 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMNAP02545 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMNAP02545 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMNAP02545 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMNAP02545 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMNAP02545 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LMNAP02545 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMNAP02545 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMNAP02545 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMNAP02545 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LMNAP02545 AL627389.1-201ENST00000413508 1182 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LMNAP02545 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LMNAP02545 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LMNAP02545 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LMNAP02545 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMNAP02545 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMNAP02545 RBM4B-202ENST00000524637 867 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMNAP02545 MPZL3-203ENST00000525386 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMNAP02545 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LMNAP02545 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LMNAP02545 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMNAP02545 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMNAP02545 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMNAP02545 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMNAP02545 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMNAP02545 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMNAP02545 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMNAP02545 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LMNAP02545 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMNAP02545 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMNAP02545 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMNAP02545 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMNAP02545 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LMNAP02545 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMNAP02545 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMNAP02545 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMNAP02545 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMNAP02545 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMNAP02545 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMNAP02545 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMNAP02545 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMNAP02545 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMNAP02545 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMNAP02545 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMNAP02545 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMNAP02545 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMNAP02545 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMNAP02545 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMNAP02545 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMNAP02545 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMNAP02545 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMNAP02545 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMNAP02545 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMNAP02545 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMNAP02545 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LMNAP02545 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMNAP02545 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMNAP02545 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMNAP02545 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMNAP02545 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMNAP02545 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMNAP02545 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMNAP02545 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMNAP02545 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMNAP02545 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMNAP02545 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMNAP02545 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LMNAP02545 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMNAP02545 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LMNAP02545 PPOX-204ENST00000462866 473 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMNAP02545 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMNAP02545 MEF2C-AS2-201ENST00000510274 463 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMNAP02545 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms