Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
NEDD8-MDP1E9PL57 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms