Protein–RNA interactions for Protein: C9JFL3

PHGR1, Proline, histidine and glycine-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 82 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHGR1C9JFL3 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 RPL13AP3-202ENST00000494676 1473 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 MRPL55-205ENST00000366731 1423 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 ATF4-202ENST00000396680 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 BFAR-203ENST00000562442 1414 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 AC237221.1-201ENST00000561575 1881 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 LINC00205-201ENST00000433465 1391 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 HTR3E-205ENST00000436361 1371 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 NOMO2-210ENST00000620440 1360 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC2.52□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 COQ3-201ENST00000254759 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 AC011287.1-201ENST00000639998 1349 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 AC010096.1-201ENST00000443897 1709 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 SERPINB8-209ENST00000636430 1719 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC2.52□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 VPS25-201ENST00000253794 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 PDCD6-201ENST00000264933 1135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 CRYGC-201ENST00000282141 629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 MRPL33-201ENST00000296102 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 CST5-201ENST00000304710 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 PYY2-201ENST00000315776 282 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 CAV2-202ENST00000343213 776 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 UBE2D3-205ENST00000350435 711 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
PHGR1C9JFL3 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms