Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF2

ARID3C, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3CA6NKF2 APOC4-202ENST00000592954 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARID3CA6NKF2 AL121956.4-201ENST00000629925 581 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARID3CA6NKF2 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARID3CA6NKF2 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARID3CA6NKF2 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARID3CA6NKF2 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARID3CA6NKF2 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARID3CA6NKF2 UPK1A-203ENST00000616789 1366 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARID3CA6NKF2 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARID3CA6NKF2 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARID3CA6NKF2 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARID3CA6NKF2 IQCJ-201ENST00000397832 1460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARID3CA6NKF2 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARID3CA6NKF2 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ARID3CA6NKF2 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARID3CA6NKF2 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARID3CA6NKF2 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARID3CA6NKF2 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARID3CA6NKF2 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARID3CA6NKF2 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARID3CA6NKF2 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARID3CA6NKF2 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARID3CA6NKF2 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARID3CA6NKF2 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARID3CA6NKF2 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARID3CA6NKF2 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARID3CA6NKF2 AL135901.1-201ENST00000451812 333 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ARID3CA6NKF2 RNF216P1-212ENST00000493407 659 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARID3CA6NKF2 AC105219.2-201ENST00000527908 299 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARID3CA6NKF2 KRT8P2-201ENST00000556193 944 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ARID3CA6NKF2 LINC02018-201ENST00000608169 1268 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARID3CA6NKF2 AC018695.6-201ENST00000614011 534 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ARID3CA6NKF2 CCDC113-206ENST00000616795 891 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARID3CA6NKF2 RHOG-201ENST00000351018 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARID3CA6NKF2 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARID3CA6NKF2 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARID3CA6NKF2 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARID3CA6NKF2 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARID3CA6NKF2 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARID3CA6NKF2 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARID3CA6NKF2 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARID3CA6NKF2 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARID3CA6NKF2 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ARID3CA6NKF2 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
ARID3CA6NKF2 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ARID3CA6NKF2 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARID3CA6NKF2 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARID3CA6NKF2 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARID3CA6NKF2 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARID3CA6NKF2 OR2K2-201ENST00000302681 1078 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARID3CA6NKF2 SURF4-203ENST00000371991 715 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARID3CA6NKF2 NSD2-209ENST00000436793 835 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARID3CA6NKF2 CSAG1-204ENST00000452779 627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARID3CA6NKF2 RN7SL23P-201ENST00000484055 275 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ARID3CA6NKF2 HINT1-205ENST00000508488 703 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARID3CA6NKF2 AC012213.1-201ENST00000517376 722 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARID3CA6NKF2 AC011383.1-201ENST00000517474 617 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARID3CA6NKF2 IGHV1-12-201ENST00000518307 205 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ARID3CA6NKF2 FXYD6-FXYD2-201ENST00000532984 670 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARID3CA6NKF2 RAP1B-216ENST00000537460 1072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARID3CA6NKF2 MIR5001-201ENST00000580185 100 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ARID3CA6NKF2 AC025048.2-201ENST00000590744 786 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARID3CA6NKF2 AC006548.2-201ENST00000605217 529 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ARID3CA6NKF2 AC008972.2-201ENST00000606587 494 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ARID3CA6NKF2 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ARID3CA6NKF2 SNRPA1-216ENST00000626000 539 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARID3CA6NKF2 PSTPIP1-207ENST00000559295 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARID3CA6NKF2 CCL5-201ENST00000603197 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARID3CA6NKF2 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARID3CA6NKF2 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARID3CA6NKF2 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARID3CA6NKF2 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARID3CA6NKF2 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARID3CA6NKF2 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARID3CA6NKF2 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARID3CA6NKF2 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARID3CA6NKF2 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARID3CA6NKF2 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARID3CA6NKF2 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARID3CA6NKF2 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARID3CA6NKF2 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARID3CA6NKF2 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARID3CA6NKF2 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARID3CA6NKF2 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARID3CA6NKF2 GSTT2-201ENST00000402588 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARID3CA6NKF2 RAD51C-203ENST00000421782 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARID3CA6NKF2 SNX3-204ENST00000426155 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARID3CA6NKF2 FOXP4-AS1-202ENST00000432751 409 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARID3CA6NKF2 AC006372.2-201ENST00000433660 292 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARID3CA6NKF2 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARID3CA6NKF2 AL355537.2-201ENST00000453367 375 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARID3CA6NKF2 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARID3CA6NKF2 AC063952.3-201ENST00000467756 308 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ARID3CA6NKF2 RN7SL375P-201ENST00000492442 298 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ARID3CA6NKF2 AC106047.2-201ENST00000511723 743 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ARID3CA6NKF2 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARID3CA6NKF2 NDUFB10P1-201ENST00000567319 521 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ARID3CA6NKF2 OCEL1-206ENST00000597836 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARID3CA6NKF2 FXYD3-204ENST00000603181 758 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARID3CA6NKF2 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.4 ms