Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNY4

TTF2, Transcription termination factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF2Q9UNY4 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TTF2Q9UNY4 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TTF2Q9UNY4 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TTF2Q9UNY4 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TTF2Q9UNY4 UPK3BL1-201ENST00000340457 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TTF2Q9UNY4 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TTF2Q9UNY4 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TTF2Q9UNY4 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TTF2Q9UNY4 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TTF2Q9UNY4 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TTF2Q9UNY4 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TTF2Q9UNY4 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TTF2Q9UNY4 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TTF2Q9UNY4 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TTF2Q9UNY4 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TTF2Q9UNY4 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TTF2Q9UNY4 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TTF2Q9UNY4 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TTF2Q9UNY4 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TTF2Q9UNY4 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TTF2Q9UNY4 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TTF2Q9UNY4 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TTF2Q9UNY4 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TTF2Q9UNY4 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TTF2Q9UNY4 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TTF2Q9UNY4 CHCHD2P9-201ENST00000461726 456 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
TTF2Q9UNY4 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TTF2Q9UNY4 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TTF2Q9UNY4 DNM1P30-201ENST00000563586 452 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
TTF2Q9UNY4 AC009560.1-201ENST00000620208 434 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
TTF2Q9UNY4 PRSS45-202ENST00000620911 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TTF2Q9UNY4 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TTF2Q9UNY4 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TTF2Q9UNY4 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TTF2Q9UNY4 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TTF2Q9UNY4 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TTF2Q9UNY4 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TTF2Q9UNY4 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TTF2Q9UNY4 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TTF2Q9UNY4 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TTF2Q9UNY4 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TTF2Q9UNY4 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TTF2Q9UNY4 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TTF2Q9UNY4 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TTF2Q9UNY4 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TTF2Q9UNY4 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TTF2Q9UNY4 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TTF2Q9UNY4 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TTF2Q9UNY4 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TTF2Q9UNY4 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TTF2Q9UNY4 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
TTF2Q9UNY4 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
TTF2Q9UNY4 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TTF2Q9UNY4 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TTF2Q9UNY4 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TTF2Q9UNY4 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TTF2Q9UNY4 AL365295.1-203ENST00000435322 566 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TTF2Q9UNY4 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TTF2Q9UNY4 FTH1P22-201ENST00000456305 520 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
TTF2Q9UNY4 KLHDC8A-203ENST00000460687 1022 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TTF2Q9UNY4 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TTF2Q9UNY4 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TTF2Q9UNY4 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TTF2Q9UNY4 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TTF2Q9UNY4 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TTF2Q9UNY4 RPL19-207ENST00000582193 792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TTF2Q9UNY4 AP001065.2-201ENST00000617205 644 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
TTF2Q9UNY4 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TTF2Q9UNY4 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TTF2Q9UNY4 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TTF2Q9UNY4 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TTF2Q9UNY4 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TTF2Q9UNY4 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TTF2Q9UNY4 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TTF2Q9UNY4 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TTF2Q9UNY4 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TTF2Q9UNY4 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TTF2Q9UNY4 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TTF2Q9UNY4 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TTF2Q9UNY4 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TTF2Q9UNY4 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TTF2Q9UNY4 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TTF2Q9UNY4 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TTF2Q9UNY4 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TTF2Q9UNY4 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TTF2Q9UNY4 MAP2K6-205ENST00000589647 1512 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TTF2Q9UNY4 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TTF2Q9UNY4 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TTF2Q9UNY4 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TTF2Q9UNY4 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TTF2Q9UNY4 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TTF2Q9UNY4 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TTF2Q9UNY4 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TTF2Q9UNY4 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TTF2Q9UNY4 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TTF2Q9UNY4 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TTF2Q9UNY4 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TTF2Q9UNY4 CGB1-201ENST00000301407 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TTF2Q9UNY4 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
TTF2Q9UNY4 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms