Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD4

BRPF3, Bromodomain and PHD finger-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF3Q9ULD4 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BRPF3Q9ULD4 AC131902.2-201ENST00000566892 2172 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
BRPF3Q9ULD4 MMAB-210ENST00000545712 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BRPF3Q9ULD4 KCNMA1-287ENST00000640632 2808 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BRPF3Q9ULD4 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BRPF3Q9ULD4 HERC5-201ENST00000264350 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BRPF3Q9ULD4 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BRPF3Q9ULD4 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BRPF3Q9ULD4 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BRPF3Q9ULD4 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BRPF3Q9ULD4 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BRPF3Q9ULD4 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BRPF3Q9ULD4 SMOC2-202ENST00000356284 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BRPF3Q9ULD4 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BRPF3Q9ULD4 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BRPF3Q9ULD4 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BRPF3Q9ULD4 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BRPF3Q9ULD4 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BRPF3Q9ULD4 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BRPF3Q9ULD4 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BRPF3Q9ULD4 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BRPF3Q9ULD4 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BRPF3Q9ULD4 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BRPF3Q9ULD4 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BRPF3Q9ULD4 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
BRPF3Q9ULD4 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
BRPF3Q9ULD4 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BRPF3Q9ULD4 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BRPF3Q9ULD4 CALD1-205ENST00000422748 2665 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BRPF3Q9ULD4 RAB37-205ENST00000392614 2704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BRPF3Q9ULD4 CAMK2B-217ENST00000457475 4142 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BRPF3Q9ULD4 ZNF519-206ENST00000589498 2117 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BRPF3Q9ULD4 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BRPF3Q9ULD4 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BRPF3Q9ULD4 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BRPF3Q9ULD4 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BRPF3Q9ULD4 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BRPF3Q9ULD4 SMTN-203ENST00000358743 3198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BRPF3Q9ULD4 METAP1D-201ENST00000315796 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BRPF3Q9ULD4 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BRPF3Q9ULD4 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BRPF3Q9ULD4 INTS6-201ENST00000311234 3662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BRPF3Q9ULD4 BUB1B-PAK6-201ENST00000441369 2767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BRPF3Q9ULD4 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BRPF3Q9ULD4 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BRPF3Q9ULD4 CYB5D1-203ENST00000571846 1870 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BRPF3Q9ULD4 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BRPF3Q9ULD4 MATN1-AS1-201ENST00000414532 3925 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BRPF3Q9ULD4 CCDC117-205ENST00000448492 3937 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BRPF3Q9ULD4 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BRPF3Q9ULD4 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BRPF3Q9ULD4 LINC00324-201ENST00000315707 2082 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BRPF3Q9ULD4 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BRPF3Q9ULD4 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BRPF3Q9ULD4 ARHGEF4-217ENST00000611048 3486 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BRPF3Q9ULD4 ZC3H18-201ENST00000301011 3729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BRPF3Q9ULD4 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BRPF3Q9ULD4 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
BRPF3Q9ULD4 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BRPF3Q9ULD4 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BRPF3Q9ULD4 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BRPF3Q9ULD4 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
BRPF3Q9ULD4 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BRPF3Q9ULD4 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BRPF3Q9ULD4 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BRPF3Q9ULD4 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BRPF3Q9ULD4 MYOM3-201ENST00000338909 2693 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BRPF3Q9ULD4 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BRPF3Q9ULD4 PTPN5-203ENST00000396168 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BRPF3Q9ULD4 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BRPF3Q9ULD4 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BRPF3Q9ULD4 SPTBN2-210ENST00000611817 2890 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BRPF3Q9ULD4 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BRPF3Q9ULD4 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BRPF3Q9ULD4 IFNA6-202ENST00000380210 1544 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BRPF3Q9ULD4 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BRPF3Q9ULD4 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BRPF3Q9ULD4 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BRPF3Q9ULD4 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
BRPF3Q9ULD4 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BRPF3Q9ULD4 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BRPF3Q9ULD4 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BRPF3Q9ULD4 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BRPF3Q9ULD4 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BRPF3Q9ULD4 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BRPF3Q9ULD4 ARSH-201ENST00000381130 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BRPF3Q9ULD4 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BRPF3Q9ULD4 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BRPF3Q9ULD4 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BRPF3Q9ULD4 ROPN1-206ENST00000479867 2056 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BRPF3Q9ULD4 CAPN14-202ENST00000403897 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BRPF3Q9ULD4 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BRPF3Q9ULD4 WARS2-201ENST00000235521 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BRPF3Q9ULD4 SLC29A4-201ENST00000297195 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BRPF3Q9ULD4 RAB37-202ENST00000392610 2858 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BRPF3Q9ULD4 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BRPF3Q9ULD4 PGGHG-204ENST00000409655 2963 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BRPF3Q9ULD4 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BRPF3Q9ULD4 PAX2-202ENST00000361791 3193 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BRPF3Q9ULD4 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms