Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSP4

CENPM, Centromere protein M, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPMQ9NSP4 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CENPMQ9NSP4 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CENPMQ9NSP4 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CENPMQ9NSP4 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CENPMQ9NSP4 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CENPMQ9NSP4 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CENPMQ9NSP4 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CENPMQ9NSP4 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CENPMQ9NSP4 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CENPMQ9NSP4 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CENPMQ9NSP4 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
CENPMQ9NSP4 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
CENPMQ9NSP4 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CENPMQ9NSP4 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
CENPMQ9NSP4 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CENPMQ9NSP4 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CENPMQ9NSP4 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
CENPMQ9NSP4 AMOTL2-212ENST00000514516 4521 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CENPMQ9NSP4 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CENPMQ9NSP4 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CENPMQ9NSP4 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CENPMQ9NSP4 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CENPMQ9NSP4 AC025594.2-201ENST00000609480 3902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CENPMQ9NSP4 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CENPMQ9NSP4 SCARB2-215ENST00000639145 4471 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CENPMQ9NSP4 PEAR1-202ENST00000338302 4970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CENPMQ9NSP4 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CENPMQ9NSP4 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CENPMQ9NSP4 SEC14L5-201ENST00000251170 6459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CENPMQ9NSP4 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CENPMQ9NSP4 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CENPMQ9NSP4 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CENPMQ9NSP4 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CENPMQ9NSP4 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CENPMQ9NSP4 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CENPMQ9NSP4 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CENPMQ9NSP4 MYO15B-236ENST00000633867 6323 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CENPMQ9NSP4 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CENPMQ9NSP4 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CENPMQ9NSP4 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CENPMQ9NSP4 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CENPMQ9NSP4 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CENPMQ9NSP4 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CENPMQ9NSP4 AFF3-201ENST00000317233 8135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CENPMQ9NSP4 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CENPMQ9NSP4 GAS6-AS1-201ENST00000458001 7169 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CENPMQ9NSP4 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CENPMQ9NSP4 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CENPMQ9NSP4 PRR12-201ENST00000418929 6955 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CENPMQ9NSP4 LDLRAD4-203ENST00000399848 8633 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CENPMQ9NSP4 CLUAP1-202ENST00000571025 5126 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CENPMQ9NSP4 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CENPMQ9NSP4 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CENPMQ9NSP4 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CENPMQ9NSP4 BDKRB2-202ENST00000542454 6845 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CENPMQ9NSP4 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CENPMQ9NSP4 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CENPMQ9NSP4 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CENPMQ9NSP4 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CENPMQ9NSP4 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CENPMQ9NSP4 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CENPMQ9NSP4 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CENPMQ9NSP4 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CENPMQ9NSP4 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CENPMQ9NSP4 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CENPMQ9NSP4 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CENPMQ9NSP4 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CENPMQ9NSP4 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CENPMQ9NSP4 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CENPMQ9NSP4 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
CENPMQ9NSP4 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CENPMQ9NSP4 RSBN1L-201ENST00000334955 6422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CENPMQ9NSP4 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CENPMQ9NSP4 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CENPMQ9NSP4 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CENPMQ9NSP4 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CENPMQ9NSP4 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CENPMQ9NSP4 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CENPMQ9NSP4 NPR1-202ENST00000368680 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CENPMQ9NSP4 LINC00384-201ENST00000437721 6852 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CENPMQ9NSP4 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CENPMQ9NSP4 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
CENPMQ9NSP4 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
CENPMQ9NSP4 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CENPMQ9NSP4 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CENPMQ9NSP4 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CENPMQ9NSP4 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CENPMQ9NSP4 TBKBP1-201ENST00000361722 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CENPMQ9NSP4 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CENPMQ9NSP4 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CENPMQ9NSP4 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CENPMQ9NSP4 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CENPMQ9NSP4 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CENPMQ9NSP4 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CENPMQ9NSP4 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CENPMQ9NSP4 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
CENPMQ9NSP4 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CENPMQ9NSP4 ARHGAP20-201ENST00000260283 6189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CENPMQ9NSP4 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CENPMQ9NSP4 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.3 ms