Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSD4

ZNF275, Zinc finger protein 275, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF275Q9NSD4 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZNF275Q9NSD4 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZNF275Q9NSD4 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
ZNF275Q9NSD4 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZNF275Q9NSD4 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
ZNF275Q9NSD4 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZNF275Q9NSD4 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZNF275Q9NSD4 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
ZNF275Q9NSD4 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZNF275Q9NSD4 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZNF275Q9NSD4 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZNF275Q9NSD4 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
ZNF275Q9NSD4 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
ZNF275Q9NSD4 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
ZNF275Q9NSD4 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZNF275Q9NSD4 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZNF275Q9NSD4 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZNF275Q9NSD4 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZNF275Q9NSD4 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZNF275Q9NSD4 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZNF275Q9NSD4 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZNF275Q9NSD4 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZNF275Q9NSD4 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
ZNF275Q9NSD4 KCNAB2-219ENST00000602612 2396 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZNF275Q9NSD4 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZNF275Q9NSD4 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
ZNF275Q9NSD4 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZNF275Q9NSD4 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZNF275Q9NSD4 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZNF275Q9NSD4 CD34-203ENST00000367036 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZNF275Q9NSD4 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZNF275Q9NSD4 LRP8-203ENST00000354412 2553 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZNF275Q9NSD4 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZNF275Q9NSD4 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZNF275Q9NSD4 NDRG4-221ENST00000563799 3014 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZNF275Q9NSD4 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZNF275Q9NSD4 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZNF275Q9NSD4 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZNF275Q9NSD4 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZNF275Q9NSD4 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZNF275Q9NSD4 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZNF275Q9NSD4 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZNF275Q9NSD4 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZNF275Q9NSD4 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZNF275Q9NSD4 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZNF275Q9NSD4 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZNF275Q9NSD4 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZNF275Q9NSD4 PNRC2-201ENST00000334351 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZNF275Q9NSD4 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZNF275Q9NSD4 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZNF275Q9NSD4 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZNF275Q9NSD4 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZNF275Q9NSD4 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZNF275Q9NSD4 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZNF275Q9NSD4 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZNF275Q9NSD4 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZNF275Q9NSD4 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZNF275Q9NSD4 PLA2G3-201ENST00000215885 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZNF275Q9NSD4 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
ZNF275Q9NSD4 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZNF275Q9NSD4 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZNF275Q9NSD4 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZNF275Q9NSD4 DMAC1-201ENST00000358227 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZNF275Q9NSD4 RHOH-224ENST00000622175 2254 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZNF275Q9NSD4 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZNF275Q9NSD4 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZNF275Q9NSD4 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZNF275Q9NSD4 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
ZNF275Q9NSD4 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZNF275Q9NSD4 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZNF275Q9NSD4 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZNF275Q9NSD4 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZNF275Q9NSD4 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
ZNF275Q9NSD4 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZNF275Q9NSD4 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZNF275Q9NSD4 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
ZNF275Q9NSD4 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
ZNF275Q9NSD4 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZNF275Q9NSD4 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZNF275Q9NSD4 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZNF275Q9NSD4 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZNF275Q9NSD4 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZNF275Q9NSD4 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
ZNF275Q9NSD4 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
ZNF275Q9NSD4 STX16-NPEPL1-202ENST00000530122 3433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZNF275Q9NSD4 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZNF275Q9NSD4 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZNF275Q9NSD4 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZNF275Q9NSD4 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZNF275Q9NSD4 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZNF275Q9NSD4 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZNF275Q9NSD4 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZNF275Q9NSD4 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZNF275Q9NSD4 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZNF275Q9NSD4 GPR68-204ENST00000535815 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZNF275Q9NSD4 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
ZNF275Q9NSD4 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
ZNF275Q9NSD4 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
ZNF275Q9NSD4 NFATC2-203ENST00000414705 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
ZNF275Q9NSD4 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.4 ms