Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQX1

PRDM5, PR domain zinc finger protein 5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM5Q9NQX1 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 PYY2-201ENST00000315776 282 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 GTF3C6-201ENST00000329970 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 AL935212.1-201ENST00000377548 906 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 NME4-203ENST00000397722 1232 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 AL391832.2-203ENST00000423175 554 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 AC015712.5-201ENST00000558568 564 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 ABHD17AP9-201ENST00000561925 548 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 AC009145.4-201ENST00000625119 1294 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 PLS3-210ENST00000626746 216 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 NDUFB11-202ENST00000377811 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 SLC25A3-216ENST00000551917 1359 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 HIST1H2AE-201ENST00000303910 509 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 ATP5S-203ENST00000358473 801 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 MBD3L4-201ENST00000381394 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 ACTG1P19-201ENST00000418987 1116 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 AC108734.2-201ENST00000420887 1069 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 RAD51C-203ENST00000421782 567 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 PRKAR2A-AS1-203ENST00000431705 592 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 LINC01278-201ENST00000433061 529 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 HMGB3-204ENST00000448905 812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 GNG10P1-201ENST00000452289 199 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 AC063952.3-201ENST00000467756 308 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 AL132801.1-201ENST00000559675 567 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 TMEM202-AS1-201ENST00000562573 723 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 MIR5001-201ENST00000580185 100 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 LINC01278-206ENST00000610088 554 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 ST5-261ENST00000626808 1071 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRDM5Q9NQX1 RBP1-205ENST00000492918 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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