Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYR9

KRTAP2-4, Keratin-associated protein 2-4, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP2-4Q9BYR9 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
KRTAP2-4Q9BYR9 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
KRTAP2-4Q9BYR9 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
KRTAP2-4Q9BYR9 AC099552.4-201ENST00000624248 949 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
KRTAP2-4Q9BYR9 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
KRTAP2-4Q9BYR9 EPM2A-214ENST00000638783 801 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
KRTAP2-4Q9BYR9 EPM2A-229ENST00000640980 647 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
KRTAP2-4Q9BYR9 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
KRTAP2-4Q9BYR9 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
KRTAP2-4Q9BYR9 MBIP-211ENST00000621657 1809 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
KRTAP2-4Q9BYR9 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
KRTAP2-4Q9BYR9 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
KRTAP2-4Q9BYR9 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
KRTAP2-4Q9BYR9 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
KRTAP2-4Q9BYR9 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
KRTAP2-4Q9BYR9 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
KRTAP2-4Q9BYR9 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
KRTAP2-4Q9BYR9 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
KRTAP2-4Q9BYR9 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
KRTAP2-4Q9BYR9 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
KRTAP2-4Q9BYR9 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
KRTAP2-4Q9BYR9 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
KRTAP2-4Q9BYR9 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
KRTAP2-4Q9BYR9 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
KRTAP2-4Q9BYR9 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
KRTAP2-4Q9BYR9 TUBAL3-201ENST00000380419 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
KRTAP2-4Q9BYR9 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
KRTAP2-4Q9BYR9 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
KRTAP2-4Q9BYR9 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
KRTAP2-4Q9BYR9 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
KRTAP2-4Q9BYR9 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
KRTAP2-4Q9BYR9 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
KRTAP2-4Q9BYR9 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
KRTAP2-4Q9BYR9 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC5.31□□□□□ -1.56
KRTAP2-4Q9BYR9 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
KRTAP2-4Q9BYR9 IQCJ-201ENST00000397832 1460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
KRTAP2-4Q9BYR9 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
KRTAP2-4Q9BYR9 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
KRTAP2-4Q9BYR9 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
KRTAP2-4Q9BYR9 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
KRTAP2-4Q9BYR9 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
KRTAP2-4Q9BYR9 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
KRTAP2-4Q9BYR9 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
KRTAP2-4Q9BYR9 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
KRTAP2-4Q9BYR9 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
KRTAP2-4Q9BYR9 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
KRTAP2-4Q9BYR9 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
KRTAP2-4Q9BYR9 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
KRTAP2-4Q9BYR9 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
KRTAP2-4Q9BYR9 MKRN2-202ENST00000411987 1436 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
KRTAP2-4Q9BYR9 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
KRTAP2-4Q9BYR9 CHIAP2-204ENST00000532686 1449 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
KRTAP2-4Q9BYR9 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
KRTAP2-4Q9BYR9 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
KRTAP2-4Q9BYR9 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
KRTAP2-4Q9BYR9 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
KRTAP2-4Q9BYR9 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
KRTAP2-4Q9BYR9 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
KRTAP2-4Q9BYR9 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
KRTAP2-4Q9BYR9 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
KRTAP2-4Q9BYR9 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
KRTAP2-4Q9BYR9 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
KRTAP2-4Q9BYR9 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
KRTAP2-4Q9BYR9 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
KRTAP2-4Q9BYR9 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
KRTAP2-4Q9BYR9 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
KRTAP2-4Q9BYR9 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
KRTAP2-4Q9BYR9 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
KRTAP2-4Q9BYR9 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
KRTAP2-4Q9BYR9 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
KRTAP2-4Q9BYR9 EIF4A1-225ENST00000582746 1645 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
KRTAP2-4Q9BYR9 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
KRTAP2-4Q9BYR9 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
KRTAP2-4Q9BYR9 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
KRTAP2-4Q9BYR9 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
KRTAP2-4Q9BYR9 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
KRTAP2-4Q9BYR9 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
KRTAP2-4Q9BYR9 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
KRTAP2-4Q9BYR9 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
KRTAP2-4Q9BYR9 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
KRTAP2-4Q9BYR9 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
KRTAP2-4Q9BYR9 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
KRTAP2-4Q9BYR9 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
KRTAP2-4Q9BYR9 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
KRTAP2-4Q9BYR9 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
KRTAP2-4Q9BYR9 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
KRTAP2-4Q9BYR9 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
KRTAP2-4Q9BYR9 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
KRTAP2-4Q9BYR9 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
KRTAP2-4Q9BYR9 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
KRTAP2-4Q9BYR9 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
KRTAP2-4Q9BYR9 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
KRTAP2-4Q9BYR9 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
KRTAP2-4Q9BYR9 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
KRTAP2-4Q9BYR9 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
KRTAP2-4Q9BYR9 UBOX5-AS1-201ENST00000446537 1792 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
KRTAP2-4Q9BYR9 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
KRTAP2-4Q9BYR9 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
KRTAP2-4Q9BYR9 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
KRTAP2-4Q9BYR9 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.5 ms