Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST3

SIN3A, Paired amphipathic helix protein Sin3a, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3AQ96ST3 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SIN3AQ96ST3 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SIN3AQ96ST3 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SIN3AQ96ST3 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SIN3AQ96ST3 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SIN3AQ96ST3 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SIN3AQ96ST3 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SIN3AQ96ST3 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SIN3AQ96ST3 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SIN3AQ96ST3 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SIN3AQ96ST3 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
SIN3AQ96ST3 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
SIN3AQ96ST3 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SIN3AQ96ST3 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SIN3AQ96ST3 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SIN3AQ96ST3 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SIN3AQ96ST3 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SIN3AQ96ST3 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SIN3AQ96ST3 LINC02486-201ENST00000604157 3000 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
SIN3AQ96ST3 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
SIN3AQ96ST3 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SIN3AQ96ST3 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SIN3AQ96ST3 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
SIN3AQ96ST3 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SIN3AQ96ST3 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SIN3AQ96ST3 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SIN3AQ96ST3 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SIN3AQ96ST3 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SIN3AQ96ST3 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SIN3AQ96ST3 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SIN3AQ96ST3 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SIN3AQ96ST3 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SIN3AQ96ST3 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SIN3AQ96ST3 RNF41-202ENST00000394013 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SIN3AQ96ST3 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SIN3AQ96ST3 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SIN3AQ96ST3 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SIN3AQ96ST3 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SIN3AQ96ST3 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SIN3AQ96ST3 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SIN3AQ96ST3 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SIN3AQ96ST3 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SIN3AQ96ST3 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SIN3AQ96ST3 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SIN3AQ96ST3 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SIN3AQ96ST3 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SIN3AQ96ST3 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SIN3AQ96ST3 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SIN3AQ96ST3 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SIN3AQ96ST3 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SIN3AQ96ST3 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SIN3AQ96ST3 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SIN3AQ96ST3 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SIN3AQ96ST3 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
SIN3AQ96ST3 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
SIN3AQ96ST3 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SIN3AQ96ST3 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SIN3AQ96ST3 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SIN3AQ96ST3 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SIN3AQ96ST3 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SIN3AQ96ST3 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SIN3AQ96ST3 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SIN3AQ96ST3 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SIN3AQ96ST3 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SIN3AQ96ST3 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SIN3AQ96ST3 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SIN3AQ96ST3 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SIN3AQ96ST3 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SIN3AQ96ST3 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SIN3AQ96ST3 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SIN3AQ96ST3 HYOU1-219ENST00000614711 3057 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SIN3AQ96ST3 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SIN3AQ96ST3 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
SIN3AQ96ST3 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SIN3AQ96ST3 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SIN3AQ96ST3 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SIN3AQ96ST3 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SIN3AQ96ST3 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SIN3AQ96ST3 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SIN3AQ96ST3 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SIN3AQ96ST3 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SIN3AQ96ST3 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
SIN3AQ96ST3 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SIN3AQ96ST3 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SIN3AQ96ST3 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SIN3AQ96ST3 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SIN3AQ96ST3 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SIN3AQ96ST3 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SIN3AQ96ST3 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SIN3AQ96ST3 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SIN3AQ96ST3 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SIN3AQ96ST3 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SIN3AQ96ST3 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SIN3AQ96ST3 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SIN3AQ96ST3 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SIN3AQ96ST3 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SIN3AQ96ST3 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SIN3AQ96ST3 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SIN3AQ96ST3 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SIN3AQ96ST3 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms