Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD8Q96LT4 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
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SAMD8Q96LT4 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SAMD8Q96LT4 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
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SAMD8Q96LT4 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
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SAMD8Q96LT4 SEZ6L-206ENST00000404234 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
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SAMD8Q96LT4 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SAMD8Q96LT4 PLCD1-204ENST00000463876 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SAMD8Q96LT4 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SAMD8Q96LT4 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SAMD8Q96LT4 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
SAMD8Q96LT4 PHF8-202ENST00000338154 6062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SAMD8Q96LT4 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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