Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
COG3Q96JB2 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
COG3Q96JB2 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
COG3Q96JB2 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
COG3Q96JB2 SDHAF2-206ENST00000542074 835 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
COG3Q96JB2 MT3-203ENST00000565838 421 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
COG3Q96JB2 AC005696.1-201ENST00000572876 443 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
COG3Q96JB2 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
COG3Q96JB2 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
COG3Q96JB2 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
COG3Q96JB2 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
COG3Q96JB2 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
COG3Q96JB2 UPK3BL1-201ENST00000340457 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
COG3Q96JB2 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
COG3Q96JB2 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
COG3Q96JB2 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
COG3Q96JB2 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
COG3Q96JB2 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
COG3Q96JB2 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
COG3Q96JB2 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
COG3Q96JB2 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
COG3Q96JB2 CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
COG3Q96JB2 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
COG3Q96JB2 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
COG3Q96JB2 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
COG3Q96JB2 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
COG3Q96JB2 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
COG3Q96JB2 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
COG3Q96JB2 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
COG3Q96JB2 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
COG3Q96JB2 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
COG3Q96JB2 CALR3-201ENST00000269881 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
COG3Q96JB2 COX14-201ENST00000317943 708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
COG3Q96JB2 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
COG3Q96JB2 DCAF7-201ENST00000415273 1220 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
COG3Q96JB2 AC105254.1-201ENST00000507782 621 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
COG3Q96JB2 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
COG3Q96JB2 FKBP11-212ENST00000552878 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
COG3Q96JB2 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
COG3Q96JB2 SNHG25-202ENST00000582965 278 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
COG3Q96JB2 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
COG3Q96JB2 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
COG3Q96JB2 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
COG3Q96JB2 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
COG3Q96JB2 AC005618.3-201ENST00000624928 458 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
COG3Q96JB2 METTL17-201ENST00000339374 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
COG3Q96JB2 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
COG3Q96JB2 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
COG3Q96JB2 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
COG3Q96JB2 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
COG3Q96JB2 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
COG3Q96JB2 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
COG3Q96JB2 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
COG3Q96JB2 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
COG3Q96JB2 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
COG3Q96JB2 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
COG3Q96JB2 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
COG3Q96JB2 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
COG3Q96JB2 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
COG3Q96JB2 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
COG3Q96JB2 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
COG3Q96JB2 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
COG3Q96JB2 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
COG3Q96JB2 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
COG3Q96JB2 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
COG3Q96JB2 HLA-DMA-203ENST00000395305 777 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
COG3Q96JB2 AL157788.1-201ENST00000437838 229 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
COG3Q96JB2 AL512330.1-201ENST00000456701 349 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
COG3Q96JB2 RPL18AP8-201ENST00000486071 528 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
COG3Q96JB2 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
COG3Q96JB2 RTN4RL2-203ENST00000533205 637 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
COG3Q96JB2 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
COG3Q96JB2 LINC01224-201ENST00000593573 798 ntTSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
COG3Q96JB2 AC242426.4-201ENST00000606856 573 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
COG3Q96JB2 AP001065.2-201ENST00000617205 644 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
COG3Q96JB2 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
COG3Q96JB2 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
COG3Q96JB2 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
COG3Q96JB2 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
COG3Q96JB2 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
COG3Q96JB2 SLC25A19-205ENST00000442286 1496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
COG3Q96JB2 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
COG3Q96JB2 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
COG3Q96JB2 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.7
COG3Q96JB2 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
COG3Q96JB2 SLC6A9-207ENST00000475075 1881 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
COG3Q96JB2 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
COG3Q96JB2 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
COG3Q96JB2 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
COG3Q96JB2 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
COG3Q96JB2 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
COG3Q96JB2 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
COG3Q96JB2 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
COG3Q96JB2 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
COG3Q96JB2 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
COG3Q96JB2 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
COG3Q96JB2 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
COG3Q96JB2 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
COG3Q96JB2 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
COG3Q96JB2 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms