Protein–RNA interactions for Protein: Q969G3

SMARCE1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1Q969G3 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMARCE1Q969G3 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMARCE1Q969G3 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMARCE1Q969G3 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMARCE1Q969G3 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMARCE1Q969G3 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMARCE1Q969G3 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMARCE1Q969G3 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SMARCE1Q969G3 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMARCE1Q969G3 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMARCE1Q969G3 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMARCE1Q969G3 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMARCE1Q969G3 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMARCE1Q969G3 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMARCE1Q969G3 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMARCE1Q969G3 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMARCE1Q969G3 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMARCE1Q969G3 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMARCE1Q969G3 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMARCE1Q969G3 SLIT3-206ENST00000519560 9706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMARCE1Q969G3 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMARCE1Q969G3 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMARCE1Q969G3 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMARCE1Q969G3 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMARCE1Q969G3 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMARCE1Q969G3 FAM219A-203ENST00000379080 3591 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMARCE1Q969G3 LANCL3-202ENST00000378621 10298 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMARCE1Q969G3 TMEM87B-201ENST00000283206 5212 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMARCE1Q969G3 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SMARCE1Q969G3 VGLL3-202ENST00000398399 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMARCE1Q969G3 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMARCE1Q969G3 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMARCE1Q969G3 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMARCE1Q969G3 TFAM-204ENST00000487519 5414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMARCE1Q969G3 TNIK-204ENST00000436636 6970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMARCE1Q969G3 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMARCE1Q969G3 UACA-201ENST00000322954 6939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMARCE1Q969G3 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMARCE1Q969G3 SIPA1L3-201ENST00000222345 7987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMARCE1Q969G3 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMARCE1Q969G3 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMARCE1Q969G3 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SMARCE1Q969G3 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMARCE1Q969G3 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMARCE1Q969G3 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMARCE1Q969G3 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMARCE1Q969G3 STAM2-201ENST00000263904 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMARCE1Q969G3 DDX31-204ENST00000372159 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMARCE1Q969G3 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMARCE1Q969G3 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMARCE1Q969G3 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMARCE1Q969G3 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMARCE1Q969G3 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMARCE1Q969G3 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMARCE1Q969G3 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SMARCE1Q969G3 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMARCE1Q969G3 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SMARCE1Q969G3 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMARCE1Q969G3 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMARCE1Q969G3 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SMARCE1Q969G3 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SMARCE1Q969G3 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SMARCE1Q969G3 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SMARCE1Q969G3 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMARCE1Q969G3 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMARCE1Q969G3 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMARCE1Q969G3 CPSF1-212ENST00000616140 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMARCE1Q969G3 BCL9L-201ENST00000334801 10005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMARCE1Q969G3 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMARCE1Q969G3 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMARCE1Q969G3 E2F7-201ENST00000322886 5740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMARCE1Q969G3 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMARCE1Q969G3 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMARCE1Q969G3 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMARCE1Q969G3 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMARCE1Q969G3 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMARCE1Q969G3 HBP1-212ENST00000485846 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMARCE1Q969G3 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMARCE1Q969G3 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMARCE1Q969G3 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMARCE1Q969G3 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMARCE1Q969G3 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMARCE1Q969G3 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMARCE1Q969G3 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMARCE1Q969G3 PLXNB2-207ENST00000449103 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMARCE1Q969G3 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMARCE1Q969G3 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMARCE1Q969G3 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMARCE1Q969G3 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMARCE1Q969G3 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMARCE1Q969G3 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMARCE1Q969G3 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMARCE1Q969G3 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMARCE1Q969G3 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SMARCE1Q969G3 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMARCE1Q969G3 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMARCE1Q969G3 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMARCE1Q969G3 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMARCE1Q969G3 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMARCE1Q969G3 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms