Protein–RNA interactions for Protein: Q969F2

NKD2, Protein naked cuticle homolog 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKD2Q969F2 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKD2Q969F2 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKD2Q969F2 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKD2Q969F2 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKD2Q969F2 CNR1-201ENST00000362094 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKD2Q969F2 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKD2Q969F2 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKD2Q969F2 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKD2Q969F2 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKD2Q969F2 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKD2Q969F2 OSMR-AS1-202ENST00000512519 837 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKD2Q969F2 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKD2Q969F2 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKD2Q969F2 AC092139.2-201ENST00000563750 754 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKD2Q969F2 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKD2Q969F2 ZNF586-204ENST00000598183 603 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKD2Q969F2 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NKD2Q969F2 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKD2Q969F2 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKD2Q969F2 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKD2Q969F2 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKD2Q969F2 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKD2Q969F2 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKD2Q969F2 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NKD2Q969F2 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKD2Q969F2 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKD2Q969F2 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKD2Q969F2 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKD2Q969F2 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKD2Q969F2 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKD2Q969F2 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKD2Q969F2 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKD2Q969F2 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKD2Q969F2 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKD2Q969F2 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NKD2Q969F2 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NKD2Q969F2 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NKD2Q969F2 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NKD2Q969F2 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NKD2Q969F2 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NKD2Q969F2 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NKD2Q969F2 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NKD2Q969F2 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NKD2Q969F2 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NKD2Q969F2 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NKD2Q969F2 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NKD2Q969F2 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NKD2Q969F2 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NKD2Q969F2 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NKD2Q969F2 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NKD2Q969F2 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NKD2Q969F2 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NKD2Q969F2 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NKD2Q969F2 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NKD2Q969F2 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NKD2Q969F2 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NKD2Q969F2 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NKD2Q969F2 AC097065.1-201ENST00000425737 517 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NKD2Q969F2 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NKD2Q969F2 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NKD2Q969F2 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NKD2Q969F2 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NKD2Q969F2 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NKD2Q969F2 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NKD2Q969F2 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NKD2Q969F2 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NKD2Q969F2 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NKD2Q969F2 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NKD2Q969F2 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NKD2Q969F2 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NKD2Q969F2 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NKD2Q969F2 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NKD2Q969F2 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NKD2Q969F2 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NKD2Q969F2 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms