Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBXN4Q92575 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBXN4Q92575 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBXN4Q92575 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBXN4Q92575 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBXN4Q92575 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBXN4Q92575 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
UBXN4Q92575 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
UBXN4Q92575 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
UBXN4Q92575 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBXN4Q92575 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBXN4Q92575 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBXN4Q92575 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBXN4Q92575 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBXN4Q92575 LGALS9-201ENST00000302228 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBXN4Q92575 AHI1-201ENST00000265602 4335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBXN4Q92575 RRM2B-211ENST00000621845 3483 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBXN4Q92575 LINC01341-202ENST00000421003 2600 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBXN4Q92575 THAP2-201ENST00000308086 5719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBXN4Q92575 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBXN4Q92575 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBXN4Q92575 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBXN4Q92575 GEM-201ENST00000297596 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBXN4Q92575 TRIB1-201ENST00000311922 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBXN4Q92575 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBXN4Q92575 CD300LB-202ENST00000392621 2286 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBXN4Q92575 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBXN4Q92575 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBXN4Q92575 NINL-203ENST00000422516 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBXN4Q92575 NAA15-201ENST00000296543 6222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBXN4Q92575 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBXN4Q92575 CX3CL1-204ENST00000565912 5796 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBXN4Q92575 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBXN4Q92575 XPO7-201ENST00000252512 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBXN4Q92575 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBXN4Q92575 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBXN4Q92575 ELAVL4-207ENST00000448907 1951 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBXN4Q92575 LINC01257-201ENST00000376678 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBXN4Q92575 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
UBXN4Q92575 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
UBXN4Q92575 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
UBXN4Q92575 NCF2-201ENST00000367535 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
UBXN4Q92575 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
UBXN4Q92575 CSF2RB-203ENST00000406230 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
UBXN4Q92575 CACNA2D2-204ENST00000424201 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 EIF4G1-219ENST00000435046 4668 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 ICOSLG-202ENST00000400377 2907 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 NTSR1-201ENST00000370501 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 CENPL-202ENST00000356198 2357 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 PRKAR1A-203ENST00000392711 4327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 TRIM69-206ENST00000559390 2486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 DMAC1-201ENST00000358227 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 KAZN-205ENST00000400798 3643 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 RIN3-212ENST00000620541 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 CACNA2D1-202ENST00000356860 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 LARP7-202ENST00000344442 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 PCDHA2-202ENST00000520672 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 MKRN1-201ENST00000255977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 TRIM46-205ENST00000392451 3195 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 NME1-209ENST00000511355 1645 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 SLC25A26-202ENST00000354883 2673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 TCN2-202ENST00000405742 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 BTRC-202ENST00000370187 6134 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 GPR35-205ENST00000438013 3821 ntAPPRIS P3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
UBXN4Q92575 ATP5L2-201ENST00000505920 799 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 146 ms