Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEW7

TMIE, Transmembrane inner ear expressed protein, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIEQ8NEW7 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TMIEQ8NEW7 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TMIEQ8NEW7 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TMIEQ8NEW7 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TMIEQ8NEW7 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TMIEQ8NEW7 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TMIEQ8NEW7 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TMIEQ8NEW7 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TMIEQ8NEW7 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TMIEQ8NEW7 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TMIEQ8NEW7 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TMIEQ8NEW7 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TMIEQ8NEW7 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TMIEQ8NEW7 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TMIEQ8NEW7 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TMIEQ8NEW7 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TMIEQ8NEW7 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TMIEQ8NEW7 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TMIEQ8NEW7 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TMIEQ8NEW7 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TMIEQ8NEW7 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TMIEQ8NEW7 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
TMIEQ8NEW7 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TMIEQ8NEW7 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TMIEQ8NEW7 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TMIEQ8NEW7 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
TMIEQ8NEW7 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TMIEQ8NEW7 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
TMIEQ8NEW7 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TMIEQ8NEW7 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TMIEQ8NEW7 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TMIEQ8NEW7 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
TMIEQ8NEW7 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
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TMIEQ8NEW7 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TMIEQ8NEW7 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TMIEQ8NEW7 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TMIEQ8NEW7 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TMIEQ8NEW7 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TMIEQ8NEW7 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
TMIEQ8NEW7 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
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TMIEQ8NEW7 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TMIEQ8NEW7 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
TMIEQ8NEW7 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TMIEQ8NEW7 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TMIEQ8NEW7 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TMIEQ8NEW7 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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TMIEQ8NEW7 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TMIEQ8NEW7 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TMIEQ8NEW7 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TMIEQ8NEW7 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
TMIEQ8NEW7 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TMIEQ8NEW7 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TMIEQ8NEW7 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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TMIEQ8NEW7 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TMIEQ8NEW7 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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TMIEQ8NEW7 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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TMIEQ8NEW7 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
TMIEQ8NEW7 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
TMIEQ8NEW7 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TMIEQ8NEW7 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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TMIEQ8NEW7 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TMIEQ8NEW7 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TMIEQ8NEW7 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TMIEQ8NEW7 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TMIEQ8NEW7 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TMIEQ8NEW7 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
TMIEQ8NEW7 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TMIEQ8NEW7 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TMIEQ8NEW7 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TMIEQ8NEW7 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TMIEQ8NEW7 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TMIEQ8NEW7 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TMIEQ8NEW7 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TMIEQ8NEW7 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
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