Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEF3

CCDC112, Coiled-coil domain-containing protein 112, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC112Q8NEF3 TOMM40L-209ENST00000545897 2807 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC112Q8NEF3 PHACTR2-202ENST00000367582 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC112Q8NEF3 AMT-221ENST00000538581 2038 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC112Q8NEF3 OS9-206ENST00000435406 2346 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC112Q8NEF3 OSBPL2-201ENST00000313733 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC112Q8NEF3 POLM-201ENST00000242248 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC112Q8NEF3 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC112Q8NEF3 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC112Q8NEF3 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC112Q8NEF3 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC112Q8NEF3 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC112Q8NEF3 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC112Q8NEF3 ARHGEF26-202ENST00000465093 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC112Q8NEF3 MEST-206ENST00000416162 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC112Q8NEF3 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC112Q8NEF3 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC112Q8NEF3 METAP1D-201ENST00000315796 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC112Q8NEF3 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC112Q8NEF3 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC112Q8NEF3 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC112Q8NEF3 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC112Q8NEF3 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC112Q8NEF3 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC112Q8NEF3 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC112Q8NEF3 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC112Q8NEF3 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC112Q8NEF3 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC112Q8NEF3 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC112Q8NEF3 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC112Q8NEF3 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC112Q8NEF3 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC112Q8NEF3 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC112Q8NEF3 BRSK1-206ENST00000590333 2977 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC112Q8NEF3 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC112Q8NEF3 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC112Q8NEF3 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC112Q8NEF3 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC112Q8NEF3 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC112Q8NEF3 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC112Q8NEF3 NRXN1-207ENST00000404971 7578 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC112Q8NEF3 OAS3-201ENST00000228928 6719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC112Q8NEF3 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC112Q8NEF3 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC112Q8NEF3 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC112Q8NEF3 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC112Q8NEF3 CCDC126-202ENST00000409765 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC112Q8NEF3 UNC5CL-201ENST00000244565 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC112Q8NEF3 LHFPL2-201ENST00000380345 5043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC112Q8NEF3 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC112Q8NEF3 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC112Q8NEF3 FAM168B-202ENST00000409185 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC112Q8NEF3 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC112Q8NEF3 USP51-201ENST00000500968 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC112Q8NEF3 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC112Q8NEF3 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC112Q8NEF3 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC112Q8NEF3 ADAM17-203ENST00000497134 1873 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC112Q8NEF3 PHF2-203ENST00000610682 2921 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC112Q8NEF3 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC112Q8NEF3 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC112Q8NEF3 RNF14-201ENST00000347642 4213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC112Q8NEF3 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC112Q8NEF3 EML1-203ENST00000334192 4064 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC112Q8NEF3 KDELR1-201ENST00000330720 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC112Q8NEF3 CAP1-203ENST00000372797 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC112Q8NEF3 SPATA7-217ENST00000556553 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC112Q8NEF3 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC112Q8NEF3 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC112Q8NEF3 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC112Q8NEF3 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC112Q8NEF3 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC112Q8NEF3 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC112Q8NEF3 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC112Q8NEF3 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC112Q8NEF3 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC112Q8NEF3 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC112Q8NEF3 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC112Q8NEF3 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC112Q8NEF3 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC112Q8NEF3 INTS1-201ENST00000404767 6959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC112Q8NEF3 ANKH-201ENST00000284268 8203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC112Q8NEF3 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC112Q8NEF3 DMAC1-201ENST00000358227 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC112Q8NEF3 LRSAM1-201ENST00000300417 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC112Q8NEF3 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC112Q8NEF3 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC112Q8NEF3 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC112Q8NEF3 KBTBD7-201ENST00000379483 4734 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC112Q8NEF3 MBP-205ENST00000397860 4844 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC112Q8NEF3 MAP7D3-201ENST00000316077 4567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC112Q8NEF3 TYK2-205ENST00000525621 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC112Q8NEF3 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC112Q8NEF3 LINC00324-201ENST00000315707 2082 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC112Q8NEF3 PAG1-201ENST00000220597 10744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC112Q8NEF3 AL359075.1-201ENST00000476232 2921 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC112Q8NEF3 KLHL13-204ENST00000371882 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC112Q8NEF3 AAR2-201ENST00000320849 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC112Q8NEF3 REC8-213ENST00000620473 2405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC112Q8NEF3 CREB3L4-204ENST00000368603 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC112Q8NEF3 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms