Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4E4

PDCL2, Phosducin-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCL2Q8N4E4 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PDCL2Q8N4E4 VPS9D1-202ENST00000561976 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PDCL2Q8N4E4 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PDCL2Q8N4E4 TOMM40L-209ENST00000545897 2807 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PDCL2Q8N4E4 SF1-205ENST00000377394 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PDCL2Q8N4E4 SLC25A29-208ENST00000554912 5169 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PDCL2Q8N4E4 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PDCL2Q8N4E4 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PDCL2Q8N4E4 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PDCL2Q8N4E4 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PDCL2Q8N4E4 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PDCL2Q8N4E4 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PDCL2Q8N4E4 ATG14-201ENST00000247178 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PDCL2Q8N4E4 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PDCL2Q8N4E4 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PDCL2Q8N4E4 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PDCL2Q8N4E4 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PDCL2Q8N4E4 AAR2-201ENST00000320849 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PDCL2Q8N4E4 BRPF1-205ENST00000433861 4304 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PDCL2Q8N4E4 STAT4-202ENST00000392320 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PDCL2Q8N4E4 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PDCL2Q8N4E4 MICAL1-202ENST00000358807 3645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PDCL2Q8N4E4 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PDCL2Q8N4E4 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PDCL2Q8N4E4 CASC10-201ENST00000377113 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PDCL2Q8N4E4 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PDCL2Q8N4E4 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PDCL2Q8N4E4 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PDCL2Q8N4E4 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PDCL2Q8N4E4 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PDCL2Q8N4E4 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PDCL2Q8N4E4 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PDCL2Q8N4E4 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PDCL2Q8N4E4 GRM1-203ENST00000361719 6754 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PDCL2Q8N4E4 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PDCL2Q8N4E4 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PDCL2Q8N4E4 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PDCL2Q8N4E4 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PDCL2Q8N4E4 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PDCL2Q8N4E4 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PDCL2Q8N4E4 AC068075.1-201ENST00000519714 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PDCL2Q8N4E4 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PDCL2Q8N4E4 CYB5D1-203ENST00000571846 1870 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PDCL2Q8N4E4 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PDCL2Q8N4E4 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PDCL2Q8N4E4 AMT-221ENST00000538581 2038 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PDCL2Q8N4E4 CDC45-205ENST00000437685 2072 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PDCL2Q8N4E4 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PDCL2Q8N4E4 SDR16C5-202ENST00000396721 2399 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PDCL2Q8N4E4 AC020658.7-201ENST00000624274 2442 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PDCL2Q8N4E4 CD34-203ENST00000367036 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PDCL2Q8N4E4 NUTM2G-201ENST00000354649 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PDCL2Q8N4E4 CYB561-202ENST00000392975 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PDCL2Q8N4E4 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PDCL2Q8N4E4 COL6A1-201ENST00000361866 4238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PDCL2Q8N4E4 PHF8-202ENST00000338154 6062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PDCL2Q8N4E4 MSRB3-202ENST00000355192 4289 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PDCL2Q8N4E4 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PDCL2Q8N4E4 PCTP-207ENST00000576183 2680 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PDCL2Q8N4E4 BEND3P3-201ENST00000611030 2440 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PDCL2Q8N4E4 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PDCL2Q8N4E4 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PDCL2Q8N4E4 TARDBP-201ENST00000240185 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PDCL2Q8N4E4 ARHGEF37-201ENST00000333677 4968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PDCL2Q8N4E4 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PDCL2Q8N4E4 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PDCL2Q8N4E4 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PDCL2Q8N4E4 AC004899.2-201ENST00000622993 3860 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PDCL2Q8N4E4 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PDCL2Q8N4E4 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PDCL2Q8N4E4 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PDCL2Q8N4E4 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PDCL2Q8N4E4 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PDCL2Q8N4E4 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PDCL2Q8N4E4 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PDCL2Q8N4E4 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PDCL2Q8N4E4 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PDCL2Q8N4E4 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PDCL2Q8N4E4 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PDCL2Q8N4E4 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PDCL2Q8N4E4 SLC1A1-201ENST00000262352 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PDCL2Q8N4E4 CEP131-201ENST00000269392 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PDCL2Q8N4E4 CD276-202ENST00000318443 3469 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PDCL2Q8N4E4 TMPRSS12-202ENST00000551456 3336 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PDCL2Q8N4E4 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PDCL2Q8N4E4 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PDCL2Q8N4E4 AC004241.5-201ENST00000623870 2448 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PDCL2Q8N4E4 OS9-206ENST00000435406 2346 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PDCL2Q8N4E4 BCKDHB-201ENST00000320393 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PDCL2Q8N4E4 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PDCL2Q8N4E4 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PDCL2Q8N4E4 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PDCL2Q8N4E4 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PDCL2Q8N4E4 C7orf57-202ENST00000420324 1957 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PDCL2Q8N4E4 AC114271.1-201ENST00000612689 2813 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PDCL2Q8N4E4 AC012349.1-201ENST00000518662 2643 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PDCL2Q8N4E4 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PDCL2Q8N4E4 RNF145-202ENST00000424310 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PDCL2Q8N4E4 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PDCL2Q8N4E4 EML1-203ENST00000334192 4064 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms