Protein–RNA interactions for Protein: Q6UX01

LMBR1L, Protein LMBR1L, humanhuman

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBR1LQ6UX01 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LMBR1LQ6UX01 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LMBR1LQ6UX01 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LMBR1LQ6UX01 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
LMBR1LQ6UX01 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
LMBR1LQ6UX01 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LMBR1LQ6UX01 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LMBR1LQ6UX01 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LMBR1LQ6UX01 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LMBR1LQ6UX01 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LMBR1LQ6UX01 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LMBR1LQ6UX01 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
LMBR1LQ6UX01 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LMBR1LQ6UX01 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LMBR1LQ6UX01 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LMBR1LQ6UX01 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
LMBR1LQ6UX01 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LMBR1LQ6UX01 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
LMBR1LQ6UX01 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
LMBR1LQ6UX01 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LMBR1LQ6UX01 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LMBR1LQ6UX01 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LMBR1LQ6UX01 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LMBR1LQ6UX01 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LMBR1LQ6UX01 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
LMBR1LQ6UX01 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LMBR1LQ6UX01 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LMBR1LQ6UX01 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
LMBR1LQ6UX01 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LMBR1LQ6UX01 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
LMBR1LQ6UX01 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LMBR1LQ6UX01 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LMBR1LQ6UX01 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LMBR1LQ6UX01 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LMBR1LQ6UX01 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LMBR1LQ6UX01 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LMBR1LQ6UX01 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LMBR1LQ6UX01 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LMBR1LQ6UX01 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LMBR1LQ6UX01 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
LMBR1LQ6UX01 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LMBR1LQ6UX01 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LMBR1LQ6UX01 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LMBR1LQ6UX01 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LMBR1LQ6UX01 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LMBR1LQ6UX01 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LMBR1LQ6UX01 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LMBR1LQ6UX01 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LMBR1LQ6UX01 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LMBR1LQ6UX01 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LMBR1LQ6UX01 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LMBR1LQ6UX01 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LMBR1LQ6UX01 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LMBR1LQ6UX01 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LMBR1LQ6UX01 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LMBR1LQ6UX01 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LMBR1LQ6UX01 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LMBR1LQ6UX01 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LMBR1LQ6UX01 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LMBR1LQ6UX01 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
LMBR1LQ6UX01 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LMBR1LQ6UX01 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LMBR1LQ6UX01 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LMBR1LQ6UX01 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LMBR1LQ6UX01 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LMBR1LQ6UX01 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LMBR1LQ6UX01 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LMBR1LQ6UX01 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LMBR1LQ6UX01 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LMBR1LQ6UX01 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LMBR1LQ6UX01 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
LMBR1LQ6UX01 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LMBR1LQ6UX01 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LMBR1LQ6UX01 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LMBR1LQ6UX01 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LMBR1LQ6UX01 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LMBR1LQ6UX01 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LMBR1LQ6UX01 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LMBR1LQ6UX01 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LMBR1LQ6UX01 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
LMBR1LQ6UX01 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LMBR1LQ6UX01 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LMBR1LQ6UX01 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LMBR1LQ6UX01 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LMBR1LQ6UX01 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LMBR1LQ6UX01 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LMBR1LQ6UX01 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LMBR1LQ6UX01 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
LMBR1LQ6UX01 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LMBR1LQ6UX01 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LMBR1LQ6UX01 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LMBR1LQ6UX01 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LMBR1LQ6UX01 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LMBR1LQ6UX01 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LMBR1LQ6UX01 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LMBR1LQ6UX01 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LMBR1LQ6UX01 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LMBR1LQ6UX01 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LMBR1LQ6UX01 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LMBR1LQ6UX01 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms