Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPU0

CENPP, Centromere protein P, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPPQ6IPU0 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CENPPQ6IPU0 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms