Protein–RNA interactions for Protein: Q658K8

EEF1DP3, Putative elongation factor 1-delta-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEF1DP3Q658K8 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EEF1DP3Q658K8 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EEF1DP3Q658K8 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EEF1DP3Q658K8 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
EEF1DP3Q658K8 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EEF1DP3Q658K8 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
EEF1DP3Q658K8 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EEF1DP3Q658K8 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EEF1DP3Q658K8 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
EEF1DP3Q658K8 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
EEF1DP3Q658K8 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
EEF1DP3Q658K8 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EEF1DP3Q658K8 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EEF1DP3Q658K8 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EEF1DP3Q658K8 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EEF1DP3Q658K8 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EEF1DP3Q658K8 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EEF1DP3Q658K8 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EEF1DP3Q658K8 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EEF1DP3Q658K8 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EEF1DP3Q658K8 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EEF1DP3Q658K8 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EEF1DP3Q658K8 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EEF1DP3Q658K8 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EEF1DP3Q658K8 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EEF1DP3Q658K8 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EEF1DP3Q658K8 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EEF1DP3Q658K8 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EEF1DP3Q658K8 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
EEF1DP3Q658K8 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EEF1DP3Q658K8 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EEF1DP3Q658K8 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EEF1DP3Q658K8 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EEF1DP3Q658K8 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EEF1DP3Q658K8 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EEF1DP3Q658K8 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EEF1DP3Q658K8 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EEF1DP3Q658K8 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EEF1DP3Q658K8 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EEF1DP3Q658K8 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EEF1DP3Q658K8 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
EEF1DP3Q658K8 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EEF1DP3Q658K8 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EEF1DP3Q658K8 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EEF1DP3Q658K8 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EEF1DP3Q658K8 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
EEF1DP3Q658K8 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EEF1DP3Q658K8 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
EEF1DP3Q658K8 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EEF1DP3Q658K8 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EEF1DP3Q658K8 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EEF1DP3Q658K8 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EEF1DP3Q658K8 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EEF1DP3Q658K8 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EEF1DP3Q658K8 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EEF1DP3Q658K8 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EEF1DP3Q658K8 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EEF1DP3Q658K8 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EEF1DP3Q658K8 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EEF1DP3Q658K8 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EEF1DP3Q658K8 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EEF1DP3Q658K8 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EEF1DP3Q658K8 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EEF1DP3Q658K8 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EEF1DP3Q658K8 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EEF1DP3Q658K8 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EEF1DP3Q658K8 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EEF1DP3Q658K8 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EEF1DP3Q658K8 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EEF1DP3Q658K8 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EEF1DP3Q658K8 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EEF1DP3Q658K8 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EEF1DP3Q658K8 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EEF1DP3Q658K8 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EEF1DP3Q658K8 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EEF1DP3Q658K8 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EEF1DP3Q658K8 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EEF1DP3Q658K8 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EEF1DP3Q658K8 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EEF1DP3Q658K8 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EEF1DP3Q658K8 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EEF1DP3Q658K8 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EEF1DP3Q658K8 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
EEF1DP3Q658K8 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EEF1DP3Q658K8 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EEF1DP3Q658K8 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EEF1DP3Q658K8 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EEF1DP3Q658K8 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EEF1DP3Q658K8 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EEF1DP3Q658K8 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
EEF1DP3Q658K8 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EEF1DP3Q658K8 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EEF1DP3Q658K8 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
EEF1DP3Q658K8 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EEF1DP3Q658K8 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EEF1DP3Q658K8 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EEF1DP3Q658K8 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EEF1DP3Q658K8 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EEF1DP3Q658K8 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EEF1DP3Q658K8 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms