Protein–RNA interactions for Protein: Q53G59

KLHL12, Kelch-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL12Q53G59 DNM3-202ENST00000367731 7613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC13.41□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC13.41□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 SP6-202ENST00000536300 3848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC13.41□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 TP53I11-222ENST00000616990 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 FLNA-203ENST00000369850 8382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 MYLK-202ENST00000354792 7531 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 KIF21B-204ENST00000461742 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 SLC4A5-205ENST00000394019 6348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 AP1B1-201ENST00000317368 3903 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 WDFY2-203ENST00000612477 6932 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 EHMT2-204ENST00000395728 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 TMEM131L-202ENST00000409663 5017 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 C1QTNF1-204ENST00000392445 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 SEC14L5-201ENST00000251170 6459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 SCAF4-202ENST00000399804 4127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 NFATC2-203ENST00000414705 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 RNF145-202ENST00000424310 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC13.4□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.4□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 SPOCK3-218ENST00000511531 2908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 RAPH1-213ENST00000630330 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 TBX3-202ENST00000349155 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 C9orf47-203ENST00000375851 4837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 ACP7-201ENST00000331256 2966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 GTF2IRD1-202ENST00000424337 3077 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 CDHR5-203ENST00000397542 3489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
KLHL12Q53G59 DNMT3B-202ENST00000328111 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms