Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y2

PKDCC, Extracellular tyrosine-protein kinase PKDCC, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCCQ504Y2 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PKDCCQ504Y2 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PKDCCQ504Y2 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PKDCCQ504Y2 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PKDCCQ504Y2 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PKDCCQ504Y2 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PKDCCQ504Y2 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PKDCCQ504Y2 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PKDCCQ504Y2 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PKDCCQ504Y2 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PKDCCQ504Y2 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PKDCCQ504Y2 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PKDCCQ504Y2 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PKDCCQ504Y2 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PKDCCQ504Y2 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PKDCCQ504Y2 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PKDCCQ504Y2 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PKDCCQ504Y2 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PKDCCQ504Y2 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PKDCCQ504Y2 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PKDCCQ504Y2 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PKDCCQ504Y2 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PKDCCQ504Y2 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PKDCCQ504Y2 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PKDCCQ504Y2 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PKDCCQ504Y2 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PKDCCQ504Y2 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PKDCCQ504Y2 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PKDCCQ504Y2 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PKDCCQ504Y2 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PKDCCQ504Y2 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PKDCCQ504Y2 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PKDCCQ504Y2 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PKDCCQ504Y2 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PKDCCQ504Y2 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PKDCCQ504Y2 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PKDCCQ504Y2 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PKDCCQ504Y2 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PKDCCQ504Y2 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PKDCCQ504Y2 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PKDCCQ504Y2 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PKDCCQ504Y2 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PKDCCQ504Y2 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PKDCCQ504Y2 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PKDCCQ504Y2 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PKDCCQ504Y2 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PKDCCQ504Y2 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PKDCCQ504Y2 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PKDCCQ504Y2 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PKDCCQ504Y2 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PKDCCQ504Y2 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PKDCCQ504Y2 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PKDCCQ504Y2 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PKDCCQ504Y2 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PKDCCQ504Y2 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PKDCCQ504Y2 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PKDCCQ504Y2 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PKDCCQ504Y2 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PKDCCQ504Y2 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PKDCCQ504Y2 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PKDCCQ504Y2 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PKDCCQ504Y2 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PKDCCQ504Y2 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PKDCCQ504Y2 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PKDCCQ504Y2 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PKDCCQ504Y2 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PKDCCQ504Y2 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PKDCCQ504Y2 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PKDCCQ504Y2 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PKDCCQ504Y2 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PKDCCQ504Y2 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PKDCCQ504Y2 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PKDCCQ504Y2 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PKDCCQ504Y2 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PKDCCQ504Y2 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PKDCCQ504Y2 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PKDCCQ504Y2 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PKDCCQ504Y2 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PKDCCQ504Y2 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PKDCCQ504Y2 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PKDCCQ504Y2 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PKDCCQ504Y2 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PKDCCQ504Y2 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PKDCCQ504Y2 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PKDCCQ504Y2 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PKDCCQ504Y2 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PKDCCQ504Y2 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PKDCCQ504Y2 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PKDCCQ504Y2 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PKDCCQ504Y2 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PKDCCQ504Y2 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PKDCCQ504Y2 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PKDCCQ504Y2 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PKDCCQ504Y2 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PKDCCQ504Y2 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PKDCCQ504Y2 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PKDCCQ504Y2 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PKDCCQ504Y2 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PKDCCQ504Y2 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PKDCCQ504Y2 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms