Protein–RNA interactions for Protein: Q49AG3

ZBED5, Zinc finger BED domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED5Q49AG3 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZBED5Q49AG3 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZBED5Q49AG3 KIF3C-202ENST00000405914 3180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZBED5Q49AG3 LARP4-201ENST00000293618 6296 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZBED5Q49AG3 NSD2-203ENST00000382888 2666 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZBED5Q49AG3 EWSAT1-201ENST00000415504 2214 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZBED5Q49AG3 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
ZBED5Q49AG3 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZBED5Q49AG3 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZBED5Q49AG3 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZBED5Q49AG3 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
ZBED5Q49AG3 AC004846.1-201ENST00000554614 3050 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZBED5Q49AG3 IL21R-204ENST00000564089 3009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZBED5Q49AG3 XIRP1-203ENST00000421646 2596 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZBED5Q49AG3 ZNF274-210ENST00000610905 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZBED5Q49AG3 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZBED5Q49AG3 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZBED5Q49AG3 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZBED5Q49AG3 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZBED5Q49AG3 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZBED5Q49AG3 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZBED5Q49AG3 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZBED5Q49AG3 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
ZBED5Q49AG3 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZBED5Q49AG3 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZBED5Q49AG3 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
ZBED5Q49AG3 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZBED5Q49AG3 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZBED5Q49AG3 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZBED5Q49AG3 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
ZBED5Q49AG3 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZBED5Q49AG3 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZBED5Q49AG3 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZBED5Q49AG3 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZBED5Q49AG3 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZBED5Q49AG3 AL359075.1-201ENST00000476232 2921 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZBED5Q49AG3 LINC02135-201ENST00000599486 2065 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZBED5Q49AG3 PGBD2-202ENST00000355360 2879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZBED5Q49AG3 TRHDE-AS1-201ENST00000426250 3684 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZBED5Q49AG3 RPS6KC1-206ENST00000543354 4082 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZBED5Q49AG3 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZBED5Q49AG3 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZBED5Q49AG3 AC016245.1-201ENST00000570335 3204 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZBED5Q49AG3 WNK1-201ENST00000315939 10452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZBED5Q49AG3 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZBED5Q49AG3 RGS9-201ENST00000262406 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZBED5Q49AG3 C3orf18-206ENST00000449241 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZBED5Q49AG3 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZBED5Q49AG3 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZBED5Q49AG3 VRK3-201ENST00000316763 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZBED5Q49AG3 MSH5-202ENST00000375740 2669 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZBED5Q49AG3 ATP2C2-AS1-201ENST00000565700 2998 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZBED5Q49AG3 SLC5A9-210ENST00000533824 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZBED5Q49AG3 AC072061.1-201ENST00000569710 2234 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
ZBED5Q49AG3 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZBED5Q49AG3 CYP4F11-204ENST00000591841 2531 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZBED5Q49AG3 MAPK4-206ENST00000592595 4330 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZBED5Q49AG3 GRM1-203ENST00000361719 6754 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZBED5Q49AG3 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZBED5Q49AG3 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZBED5Q49AG3 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZBED5Q49AG3 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZBED5Q49AG3 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZBED5Q49AG3 METAP1D-201ENST00000315796 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZBED5Q49AG3 AL731571.1-201ENST00000617058 5428 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
ZBED5Q49AG3 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZBED5Q49AG3 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZBED5Q49AG3 MYADM-201ENST00000336967 3047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZBED5Q49AG3 RBSN-207ENST00000476527 3005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZBED5Q49AG3 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZBED5Q49AG3 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZBED5Q49AG3 ELAVL4-207ENST00000448907 1951 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZBED5Q49AG3 LARP7-202ENST00000344442 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZBED5Q49AG3 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZBED5Q49AG3 CLOCK-211ENST00000513440 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZBED5Q49AG3 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZBED5Q49AG3 CPSF1-212ENST00000616140 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZBED5Q49AG3 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZBED5Q49AG3 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZBED5Q49AG3 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZBED5Q49AG3 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZBED5Q49AG3 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZBED5Q49AG3 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
ZBED5Q49AG3 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
ZBED5Q49AG3 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZBED5Q49AG3 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZBED5Q49AG3 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZBED5Q49AG3 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZBED5Q49AG3 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZBED5Q49AG3 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZBED5Q49AG3 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZBED5Q49AG3 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZBED5Q49AG3 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZBED5Q49AG3 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
ZBED5Q49AG3 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
ZBED5Q49AG3 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZBED5Q49AG3 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZBED5Q49AG3 KIF21B-201ENST00000332129 9897 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZBED5Q49AG3 ZNF800-203ENST00000393313 4358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZBED5Q49AG3 ZFYVE27-202ENST00000357540 2765 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms