Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXZ7

TTLL9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL9Q3SXZ7 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TTLL9Q3SXZ7 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TTLL9Q3SXZ7 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TTLL9Q3SXZ7 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TTLL9Q3SXZ7 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TTLL9Q3SXZ7 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TTLL9Q3SXZ7 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TTLL9Q3SXZ7 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
TTLL9Q3SXZ7 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TTLL9Q3SXZ7 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TTLL9Q3SXZ7 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
TTLL9Q3SXZ7 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TTLL9Q3SXZ7 SMARCA4-204ENST00000444061 4938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
TTLL9Q3SXZ7 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TTLL9Q3SXZ7 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TTLL9Q3SXZ7 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TTLL9Q3SXZ7 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TTLL9Q3SXZ7 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TTLL9Q3SXZ7 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TTLL9Q3SXZ7 TMEM132C-201ENST00000435159 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
TTLL9Q3SXZ7 PXDN-201ENST00000252804 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TTLL9Q3SXZ7 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
TTLL9Q3SXZ7 UACA-201ENST00000322954 6939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TTLL9Q3SXZ7 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
TTLL9Q3SXZ7 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TTLL9Q3SXZ7 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TTLL9Q3SXZ7 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TTLL9Q3SXZ7 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TTLL9Q3SXZ7 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
TTLL9Q3SXZ7 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
TTLL9Q3SXZ7 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
TTLL9Q3SXZ7 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TTLL9Q3SXZ7 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
TTLL9Q3SXZ7 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TTLL9Q3SXZ7 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
TTLL9Q3SXZ7 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TTLL9Q3SXZ7 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
TTLL9Q3SXZ7 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
TTLL9Q3SXZ7 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
TTLL9Q3SXZ7 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
TTLL9Q3SXZ7 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
TTLL9Q3SXZ7 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
TTLL9Q3SXZ7 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
TTLL9Q3SXZ7 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
TTLL9Q3SXZ7 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
TTLL9Q3SXZ7 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TTLL9Q3SXZ7 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
TTLL9Q3SXZ7 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TTLL9Q3SXZ7 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TTLL9Q3SXZ7 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
TTLL9Q3SXZ7 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
TTLL9Q3SXZ7 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
TTLL9Q3SXZ7 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
TTLL9Q3SXZ7 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.1
TTLL9Q3SXZ7 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC14.46□□□□□ -0.1
TTLL9Q3SXZ7 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
TTLL9Q3SXZ7 CEMIP-201ENST00000220244 7226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
TTLL9Q3SXZ7 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
TTLL9Q3SXZ7 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
TTLL9Q3SXZ7 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
TTLL9Q3SXZ7 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
TTLL9Q3SXZ7 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
TTLL9Q3SXZ7 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
TTLL9Q3SXZ7 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
TTLL9Q3SXZ7 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
TTLL9Q3SXZ7 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
TTLL9Q3SXZ7 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
TTLL9Q3SXZ7 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
TTLL9Q3SXZ7 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
TTLL9Q3SXZ7 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
TTLL9Q3SXZ7 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
TTLL9Q3SXZ7 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
TTLL9Q3SXZ7 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
TTLL9Q3SXZ7 NACC2-202ENST00000371753 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
TTLL9Q3SXZ7 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
TTLL9Q3SXZ7 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
TTLL9Q3SXZ7 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
TTLL9Q3SXZ7 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
TTLL9Q3SXZ7 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
TTLL9Q3SXZ7 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
TTLL9Q3SXZ7 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
TTLL9Q3SXZ7 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC14.45□□□□□ -0.1
TTLL9Q3SXZ7 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC14.45□□□□□ -0.1
TTLL9Q3SXZ7 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
TTLL9Q3SXZ7 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
TTLL9Q3SXZ7 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
TTLL9Q3SXZ7 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
TTLL9Q3SXZ7 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC14.45□□□□□ -0.1
TTLL9Q3SXZ7 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
TTLL9Q3SXZ7 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
TTLL9Q3SXZ7 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
TTLL9Q3SXZ7 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
TTLL9Q3SXZ7 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
TTLL9Q3SXZ7 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
TTLL9Q3SXZ7 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
TTLL9Q3SXZ7 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
TTLL9Q3SXZ7 KIF21B-201ENST00000332129 9897 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
TTLL9Q3SXZ7 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
TTLL9Q3SXZ7 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
TTLL9Q3SXZ7 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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